Protein–RNA interactions for Protein: P45818

ROK1, ATP-dependent RNA helicase ROK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROK1P45818 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.87■□□□□ 0.93
ROK1P45818 NSR1YGR159C 1245 nt20.78■□□□□ 0.92
ROK1P45818 NOP1YDL014W 984 nt20.33■□□□□ 0.85
ROK1P45818 YKL036CYKL036C 393 nt18.73■□□□□ 0.59
ROK1P45818 MDJ1YFL016C 1536 nt18.4■□□□□ 0.54
ROK1P45818 Q0297Q0297 156 nt17.79■□□□□ 0.44
ROK1P45818 SRX1YKL086W 384 nt17.75■□□□□ 0.43
ROK1P45818 YJL027CYJL027C 417 nt17.47■□□□□ 0.39
ROK1P45818 SCS3YGL126W 1143 nt17.01■□□□□ 0.31
ROK1P45818 YCR051WYCR051W 669 nt16.81■□□□□ 0.28
ROK1P45818 DBP2YNL112W 1641 nt16.3■□□□□ 0.2
ROK1P45818 YOL085CYOL085C 342 nt16.21■□□□□ 0.19
ROK1P45818 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.04■□□□□ 0.16
ROK1P45818 RPP1BYDL130W 321 nt15.95■□□□□ 0.14
ROK1P45818 PKP1YIL042C 1185 nt15.93■□□□□ 0.14
ROK1P45818 CCC1YLR220W 969 nt15.85■□□□□ 0.13
ROK1P45818 YBR190WYBR190W 312 nt15.75■□□□□ 0.11
ROK1P45818 RTC3YHR087W 336 nt15.37■□□□□ 0.05
ROK1P45818 RVS167YDR388W 1449 nt15.35■□□□□ 0.05
ROK1P45818 ATS1YAL020C 1002 nt15.23■□□□□ 0.03
ROK1P45818 SCJ1YMR214W 1134 nt15.23■□□□□ 0.03
ROK1P45818 PET122YER153C 765 nt15.21■□□□□ 0.03
ROK1P45818 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.18■□□□□ 0.02
ROK1P45818 SCR1SCR1 522 nt15.09■□□□□ 0.01
ROK1P45818 SHR5YOL110W 714 nt14.82□□□□□ -0.04
ROK1P45818 RRN5YLR141W 1092 nt14.78□□□□□ -0.04
ROK1P45818 YDJ1YNL064C 1230 nt14.7□□□□□ -0.06
ROK1P45818 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.49□□□□□ -0.09
ROK1P45818 RSB1YOR049C 1065 nt14.47□□□□□ -0.09
ROK1P45818 URN1YPR152C 1398 nt14.38□□□□□ -0.11
ROK1P45818 DEP1YAL013W 1218 nt14.34□□□□□ -0.11
ROK1P45818 GAR1YHR089C 618 nt14.33□□□□□ -0.12
ROK1P45818 PUT4YOR348C 1884 nt14.27□□□□□ -0.12
ROK1P45818 RPN10YHR200W 807 nt14.2□□□□□ -0.14
ROK1P45818 OPI9YLR338W 858 nt14.2□□□□□ -0.14
ROK1P45818 YNL208WYNL208W 600 nt14.17□□□□□ -0.14
ROK1P45818 PST2YDR032C 597 nt14.11□□□□□ -0.15
ROK1P45818 SAH1YER043C 1350 nt14.08□□□□□ -0.16
ROK1P45818 ARE1YCR048W 1833 nt14.01□□□□□ -0.17
ROK1P45818 SSA3YBL075C 1950 nt13.91□□□□□ -0.18
ROK1P45818 TIR1YER011W 765 nt13.88□□□□□ -0.19
ROK1P45818 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.82□□□□□ -0.2
ROK1P45818 POA1YBR022W 534 nt13.82□□□□□ -0.2
ROK1P45818 PUN1YLR414C 792 nt13.8□□□□□ -0.2
ROK1P45818 YJR018WYJR018W 363 nt13.74□□□□□ -0.21
ROK1P45818 SSA1YAL005C 1929 nt13.69□□□□□ -0.22
ROK1P45818 PTC2YER089C 1395 nt13.59□□□□□ -0.23
ROK1P45818 YKL097CYKL097C 411 nt13.54□□□□□ -0.24
ROK1P45818 SHU1YHL006C 453 nt13.52□□□□□ -0.25
ROK1P45818 BSC6YOL137W 1494 nt13.52□□□□□ -0.25
ROK1P45818 BUD23YCR047C 828 nt13.5□□□□□ -0.25
ROK1P45818 YJR120WYJR120W 351 nt13.5□□□□□ -0.25
ROK1P45818 RPP2BYDR382W 333 nt13.48□□□□□ -0.25
ROK1P45818 NAB2YGL122C 1578 nt13.45□□□□□ -0.26
ROK1P45818 SRB2YHR041C 633 nt13.42□□□□□ -0.26
ROK1P45818 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.29□□□□□ -0.28
ROK1P45818 INM2YDR287W 879 nt13.27□□□□□ -0.29
ROK1P45818 DAL1YIR027C 1383 nt13.26□□□□□ -0.29
ROK1P45818 WWM1YFL010C 636 nt13.25□□□□□ -0.29
ROK1P45818 FIS1YIL065C 468 nt13.23□□□□□ -0.29
ROK1P45818 YGR021WYGR021W 873 nt13.21□□□□□ -0.29
ROK1P45818 BDH2YAL061W 1254 nt13.2□□□□□ -0.3
ROK1P45818 FPR4YLR449W 1179 nt13.2□□□□□ -0.3
ROK1P45818 PHO4YFR034C 939 nt13.13□□□□□ -0.31
ROK1P45818 HOM6YJR139C 1080 nt13.13□□□□□ -0.31
ROK1P45818 YBL100CYBL100C 315 nt13.12□□□□□ -0.31
ROK1P45818 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.07□□□□□ -0.32
ROK1P45818 LSM3YLR438C-A 270 nt13.05□□□□□ -0.32
ROK1P45818 MNP1YGL068W 585 nt13.03□□□□□ -0.32
ROK1P45818 YOR139CYOR139C 393 nt12.99□□□□□ -0.33
ROK1P45818 FUN26YAL022C 1554 nt12.96□□□□□ -0.33
ROK1P45818 TRM9YML014W 840 nt12.95□□□□□ -0.34
ROK1P45818 RKM5YLR137W 1104 nt12.94□□□□□ -0.34
ROK1P45818 NPL3YDR432W 1245 nt12.9□□□□□ -0.34
ROK1P45818 SPT5YML010W 3192 nt12.89□□□□□ -0.35
ROK1P45818 YPS1YLR120C 1710 nt12.88□□□□□ -0.35
ROK1P45818 YOL037CYOL037C 354 nt12.87□□□□□ -0.35
ROK1P45818 CCT6YDR188W 1641 nt12.83□□□□□ -0.36
ROK1P45818 YDR095CYDR095C 411 nt12.8□□□□□ -0.36
ROK1P45818 ALF1YNL148C 765 nt12.78□□□□□ -0.36
ROK1P45818 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.73□□□□□ -0.37
ROK1P45818 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.72□□□□□ -0.37
ROK1P45818 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.72□□□□□ -0.37
ROK1P45818 MEP2YNL142W 1500 nt12.71□□□□□ -0.38
ROK1P45818 SIS1YNL007C 1059 nt12.6□□□□□ -0.39
ROK1P45818 YLR281CYLR281C 468 nt12.56□□□□□ -0.4
ROK1P45818 RPP2AYOL039W 321 nt12.56□□□□□ -0.4
ROK1P45818 Q0182Q0182 405 nt12.53□□□□□ -0.4
ROK1P45818 WHI5YOR083W 888 nt12.51□□□□□ -0.41
ROK1P45818 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
ROK1P45818 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.5□□□□□ -0.41
ROK1P45818 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
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