Protein–RNA interactions for Protein: Q01846

MDM1, Structural protein MDM1, yeastyeast

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Length 1,127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM1Q01846 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q01846 NSR1YGR159C 1245 nt23.16■■□□□ 1.3
MDM1Q01846 NOP1YDL014W 984 nt22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q01846 YKL036CYKL036C 393 nt21.21■□□□□ 0.99
MDM1Q01846 MDJ1YFL016C 1536 nt20.49■□□□□ 0.87
MDM1Q01846 Q0297Q0297 156 nt20.03■□□□□ 0.8
MDM1Q01846 SRX1YKL086W 384 nt19.95■□□□□ 0.78
MDM1Q01846 YJL027CYJL027C 417 nt19.83■□□□□ 0.77
MDM1Q01846 SCS3YGL126W 1143 nt19.37■□□□□ 0.69
MDM1Q01846 YCR051WYCR051W 669 nt18.98■□□□□ 0.63
MDM1Q01846 YOL085CYOL085C 342 nt18.38■□□□□ 0.53
MDM1Q01846 DBP2YNL112W 1641 nt18.17■□□□□ 0.5
MDM1Q01846 PKP1YIL042C 1185 nt18.12■□□□□ 0.49
MDM1Q01846 RPP1BYDL130W 321 nt17.99■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.96■□□□□ 0.47
MDM1Q01846 CCC1YLR220W 969 nt17.84■□□□□ 0.45
MDM1Q01846 YBR190WYBR190W 312 nt17.39■□□□□ 0.37
MDM1Q01846 ATS1YAL020C 1002 nt17.37■□□□□ 0.37
MDM1Q01846 SCJ1YMR214W 1134 nt17.28■□□□□ 0.36
MDM1Q01846 PET122YER153C 765 nt17.19■□□□□ 0.34
MDM1Q01846 RVS167YDR388W 1449 nt17.07■□□□□ 0.32
MDM1Q01846 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.06■□□□□ 0.32
MDM1Q01846 RTC3YHR087W 336 nt17.05■□□□□ 0.32
MDM1Q01846 SCR1SCR1 522 nt17.02■□□□□ 0.32
MDM1Q01846 RRN5YLR141W 1092 nt16.72■□□□□ 0.27
MDM1Q01846 SHR5YOL110W 714 nt16.52■□□□□ 0.24
MDM1Q01846 YDJ1YNL064C 1230 nt16.47■□□□□ 0.23
MDM1Q01846 RSB1YOR049C 1065 nt16.4■□□□□ 0.22
MDM1Q01846 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.38■□□□□ 0.21
MDM1Q01846 GAR1YHR089C 618 nt16.12■□□□□ 0.17
MDM1Q01846 PST2YDR032C 597 nt16.07■□□□□ 0.16
MDM1Q01846 DEP1YAL013W 1218 nt16.07■□□□□ 0.16
MDM1Q01846 URN1YPR152C 1398 nt16■□□□□ 0.15
MDM1Q01846 YNL208WYNL208W 600 nt15.78■□□□□ 0.12
MDM1Q01846 RPN10YHR200W 807 nt15.75■□□□□ 0.11
MDM1Q01846 OPI9YLR338W 858 nt15.72■□□□□ 0.11
MDM1Q01846 PUT4YOR348C 1884 nt15.69■□□□□ 0.1
MDM1Q01846 SAH1YER043C 1350 nt15.62■□□□□ 0.09
MDM1Q01846 TIR1YER011W 765 nt15.56■□□□□ 0.08
MDM1Q01846 YKL097CYKL097C 411 nt15.49■□□□□ 0.07
MDM1Q01846 ARE1YCR048W 1833 nt15.46■□□□□ 0.07
MDM1Q01846 SHU1YHL006C 453 nt15.4■□□□□ 0.06
MDM1Q01846 SSA1YAL005C 1929 nt15.36■□□□□ 0.05
MDM1Q01846 YJR018WYJR018W 363 nt15.27■□□□□ 0.04
MDM1Q01846 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.26■□□□□ 0.03
MDM1Q01846 PUN1YLR414C 792 nt15.25■□□□□ 0.03
MDM1Q01846 POA1YBR022W 534 nt15.25■□□□□ 0.03
MDM1Q01846 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.17■□□□□ 0.02
MDM1Q01846 SRB2YHR041C 633 nt15.16■□□□□ 0.02
MDM1Q01846 YJR120WYJR120W 351 nt15.08■□□□□ 0
MDM1Q01846 PTC2YER089C 1395 nt15.08■□□□□ 0
MDM1Q01846 RPP2BYDR382W 333 nt14.98□□□□□ -0.01
MDM1Q01846 BUD23YCR047C 828 nt14.95□□□□□ -0.02
MDM1Q01846 WWM1YFL010C 636 nt14.92□□□□□ -0.02
MDM1Q01846 SSA3YBL075C 1950 nt14.9□□□□□ -0.02
MDM1Q01846 YOR139CYOR139C 393 nt14.87□□□□□ -0.03
MDM1Q01846 BSC6YOL137W 1494 nt14.87□□□□□ -0.03
MDM1Q01846 NAB2YGL122C 1578 nt14.85□□□□□ -0.03
MDM1Q01846 YGR021WYGR021W 873 nt14.82□□□□□ -0.04
MDM1Q01846 HOM6YJR139C 1080 nt14.8□□□□□ -0.04
MDM1Q01846 MNP1YGL068W 585 nt14.78□□□□□ -0.04
MDM1Q01846 BDH2YAL061W 1254 nt14.71□□□□□ -0.05
MDM1Q01846 INM2YDR287W 879 nt14.69□□□□□ -0.06
MDM1Q01846 NPL3YDR432W 1245 nt14.69□□□□□ -0.06
MDM1Q01846 FPR4YLR449W 1179 nt14.68□□□□□ -0.06
MDM1Q01846 DAL1YIR027C 1383 nt14.68□□□□□ -0.06
MDM1Q01846 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.64□□□□□ -0.07
MDM1Q01846 FIS1YIL065C 468 nt14.64□□□□□ -0.07
MDM1Q01846 YBL100CYBL100C 315 nt14.59□□□□□ -0.07
MDM1Q01846 RKM5YLR137W 1104 nt14.58□□□□□ -0.08
MDM1Q01846 PHO4YFR034C 939 nt14.55□□□□□ -0.08
MDM1Q01846 LSM3YLR438C-A 270 nt14.54□□□□□ -0.08
MDM1Q01846 YOL037CYOL037C 354 nt14.53□□□□□ -0.08
MDM1Q01846 TRM9YML014W 840 nt14.43□□□□□ -0.1
MDM1Q01846 FUN26YAL022C 1554 nt14.43□□□□□ -0.1
MDM1Q01846 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.29□□□□□ -0.12
MDM1Q01846 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.29□□□□□ -0.12
MDM1Q01846 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.29□□□□□ -0.12
MDM1Q01846 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.29□□□□□ -0.12
MDM1Q01846 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.29□□□□□ -0.12
MDM1Q01846 CCT6YDR188W 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
MDM1Q01846 YLR281CYLR281C 468 nt14.23□□□□□ -0.13
MDM1Q01846 YPS1YLR120C 1710 nt14.2□□□□□ -0.14
MDM1Q01846 Q0182Q0182 405 nt14.19□□□□□ -0.14
MDM1Q01846 ALF1YNL148C 765 nt14.18□□□□□ -0.14
MDM1Q01846 WHI5YOR083W 888 nt14.17□□□□□ -0.14
MDM1Q01846 PUS2YGL063W 1113 nt14.16□□□□□ -0.14
MDM1Q01846 YDR095CYDR095C 411 nt14.13□□□□□ -0.15
MDM1Q01846 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.1□□□□□ -0.15
MDM1Q01846 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.1□□□□□ -0.15
MDM1Q01846 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.05□□□□□ -0.16
MDM1Q01846 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.04□□□□□ -0.16
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