Protein–RNA interactions for Protein: Q03012

SPP1, COMPASS component SPP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPP1Q03012 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.88■■□□□ 1.09
SPP1Q03012 NSR1YGR159C 1245 nt21.33■■□□□ 1.01
SPP1Q03012 NOP1YDL014W 984 nt21.31■■□□□ 1
SPP1Q03012 YKL036CYKL036C 393 nt20.08■□□□□ 0.81
SPP1Q03012 Q0297Q0297 156 nt18.83■□□□□ 0.6
SPP1Q03012 YJL027CYJL027C 417 nt18.82■□□□□ 0.6
SPP1Q03012 MDJ1YFL016C 1536 nt18.71■□□□□ 0.59
SPP1Q03012 SRX1YKL086W 384 nt18.68■□□□□ 0.58
SPP1Q03012 SCS3YGL126W 1143 nt18.53■□□□□ 0.56
SPP1Q03012 YCR051WYCR051W 669 nt17.77■□□□□ 0.44
SPP1Q03012 YOL085CYOL085C 342 nt17.41■□□□□ 0.38
SPP1Q03012 PKP1YIL042C 1185 nt17.15■□□□□ 0.34
SPP1Q03012 RPP1BYDL130W 321 nt16.91■□□□□ 0.3
SPP1Q03012 SCJ1YMR214W 1134 nt16.78■□□□□ 0.28
SPP1Q03012 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.71■□□□□ 0.27
SPP1Q03012 DBP2YNL112W 1641 nt16.7■□□□□ 0.26
SPP1Q03012 ATS1YAL020C 1002 nt16.64■□□□□ 0.25
SPP1Q03012 YGR139WYGR139W 339 nt16.55■□□□□ 0.24
SPP1Q03012 CCC1YLR220W 969 nt16.54■□□□□ 0.24
SPP1Q03012 VAR1Q0140 1197 nt16.52■□□□□ 0.24
SPP1Q03012 PET122YER153C 765 nt16.17■□□□□ 0.18
SPP1Q03012 SCR1SCR1 522 nt16■□□□□ 0.15
SPP1Q03012 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.92■□□□□ 0.14
SPP1Q03012 YBR190WYBR190W 312 nt15.75■□□□□ 0.11
SPP1Q03012 RRN5YLR141W 1092 nt15.71■□□□□ 0.11
SPP1Q03012 RVS167YDR388W 1449 nt15.67■□□□□ 0.1
SPP1Q03012 RSB1YOR049C 1065 nt15.49■□□□□ 0.07
SPP1Q03012 RTC3YHR087W 336 nt15.44■□□□□ 0.06
SPP1Q03012 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.42■□□□□ 0.06
SPP1Q03012 YDJ1YNL064C 1230 nt15.36■□□□□ 0.05
SPP1Q03012 PST2YDR032C 597 nt15.35■□□□□ 0.05
SPP1Q03012 YDR509WYDR509W 348 nt15.28■□□□□ 0.04
SPP1Q03012 SHR5YOL110W 714 nt15.26■□□□□ 0.03
SPP1Q03012 Q0017Q0017 162 nt15.19■□□□□ 0.02
SPP1Q03012 GAR1YHR089C 618 nt15□□□□□ -0.01
SPP1Q03012 Q0142Q0142 177 nt14.98□□□□□ -0.01
SPP1Q03012 YKL097CYKL097C 411 nt14.93□□□□□ -0.02
SPP1Q03012 DEP1YAL013W 1218 nt14.76□□□□□ -0.05
SPP1Q03012 SHU1YHL006C 453 nt14.68□□□□□ -0.06
SPP1Q03012 Q0144Q0144 330 nt14.64□□□□□ -0.07
SPP1Q03012 URN1YPR152C 1398 nt14.62□□□□□ -0.07
SPP1Q03012 PAM17YKR065C 594 nt14.62□□□□□ -0.07
SPP1Q03012 CSM2YIL132C 642 nt14.58□□□□□ -0.08
SPP1Q03012 PAU21YOR394W 495 nt14.52□□□□□ -0.09
SPP1Q03012 PAU22YPL282C 495 nt14.52□□□□□ -0.09
SPP1Q03012 NME1NME1 340 nt14.51□□□□□ -0.09
SPP1Q03012 YNL208WYNL208W 600 nt14.5□□□□□ -0.09
SPP1Q03012 TIR1YER011W 765 nt14.47□□□□□ -0.09
SPP1Q03012 RPN10YHR200W 807 nt14.42□□□□□ -0.1
SPP1Q03012 ARO7YPR060C 771 nt14.37□□□□□ -0.11
SPP1Q03012 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.35□□□□□ -0.11
SPP1Q03012 BMT5YIL096C 1011 nt14.33□□□□□ -0.12
SPP1Q03012 YOR139CYOR139C 393 nt14.33□□□□□ -0.12
SPP1Q03012 SEM1YDR363W-A 270 nt14.31□□□□□ -0.12
SPP1Q03012 OPI9YLR338W 858 nt14.31□□□□□ -0.12
SPP1Q03012 SSA1YAL005C 1929 nt14.26□□□□□ -0.13
SPP1Q03012 BUR6YER159C 429 nt14.23□□□□□ -0.13
SPP1Q03012 Q0255Q0255 1419 nt14.23□□□□□ -0.13
SPP1Q03012 REG2YBR050C 1017 nt14.2□□□□□ -0.14
SPP1Q03012 SRB2YHR041C 633 nt14.19□□□□□ -0.14
SPP1Q03012 YOR169CYOR169C 465 nt14.17□□□□□ -0.14
SPP1Q03012 SAH1YER043C 1350 nt14.17□□□□□ -0.14
SPP1Q03012 AI5_BETAQ0075 1065 nt14.11□□□□□ -0.15
SPP1Q03012 YGL188CYGL188C 174 nt14.11□□□□□ -0.15
SPP1Q03012 PUT4YOR348C 1884 nt14.08□□□□□ -0.16
SPP1Q03012 NPL3YDR432W 1245 nt14.05□□□□□ -0.16
SPP1Q03012 MNP1YGL068W 585 nt13.98□□□□□ -0.17
SPP1Q03012 ARE1YCR048W 1833 nt13.96□□□□□ -0.17
SPP1Q03012 YJR018WYJR018W 363 nt13.95□□□□□ -0.18
SPP1Q03012 WWM1YFL010C 636 nt13.93□□□□□ -0.18
SPP1Q03012 YJR120WYJR120W 351 nt13.93□□□□□ -0.18
SPP1Q03012 HOM6YJR139C 1080 nt13.93□□□□□ -0.18
SPP1Q03012 AI3Q0060 1248 nt13.9□□□□□ -0.18
SPP1Q03012 MOT3YMR070W 1473 nt13.89□□□□□ -0.19
SPP1Q03012 YGR021WYGR021W 873 nt13.88□□□□□ -0.19
SPP1Q03012 PUN1YLR414C 792 nt13.88□□□□□ -0.19
SPP1Q03012 SSA3YBL075C 1950 nt13.85□□□□□ -0.19
SPP1Q03012 Q0010Q0010 387 nt13.85□□□□□ -0.19
SPP1Q03012 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt13.82□□□□□ -0.2
SPP1Q03012 YOL037CYOL037C 354 nt13.8□□□□□ -0.2
SPP1Q03012 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.77□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 SRN2YLR119W 642 nt13.75□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 ATP6Q0085 780 nt13.73□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 YCR099CYCR099C 468 nt13.72□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 RPP2BYDR382W 333 nt13.72□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 RKM5YLR137W 1104 nt13.72□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.71□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.71□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.71□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.71□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.71□□□□□ -0.21
SPP1Q03012 Q0182Q0182 405 nt13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms