Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.15■■□□□ 1.62
SYF1Q04048 NOP1YDL014W 984 nt24.59■■□□□ 1.53
SYF1Q04048 NSR1YGR159C 1245 nt24.54■■□□□ 1.52
SYF1Q04048 YKL036CYKL036C 393 nt23.13■■□□□ 1.29
SYF1Q04048 YJL027CYJL027C 417 nt21.71■■□□□ 1.07
SYF1Q04048 Q0297Q0297 156 nt21.66■■□□□ 1.06
SYF1Q04048 SRX1YKL086W 384 nt21.48■■□□□ 1.03
SYF1Q04048 MDJ1YFL016C 1536 nt21.39■■□□□ 1.01
SYF1Q04048 SCS3YGL126W 1143 nt21.27■■□□□ 1
SYF1Q04048 YCR051WYCR051W 669 nt20.48■□□□□ 0.87
SYF1Q04048 YOL085CYOL085C 342 nt20.02■□□□□ 0.8
SYF1Q04048 PKP1YIL042C 1185 nt19.72■□□□□ 0.75
SYF1Q04048 RPP1BYDL130W 321 nt19.45■□□□□ 0.7
SYF1Q04048 SCJ1YMR214W 1134 nt19.38■□□□□ 0.69
SYF1Q04048 ATS1YAL020C 1002 nt19.18■□□□□ 0.66
SYF1Q04048 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.14■□□□□ 0.65
SYF1Q04048 DBP2YNL112W 1641 nt19.07■□□□□ 0.64
SYF1Q04048 CCC1YLR220W 969 nt19.05■□□□□ 0.64
SYF1Q04048 PET122YER153C 765 nt18.54■□□□□ 0.56
SYF1Q04048 SCR1SCR1 522 nt18.48■□□□□ 0.55
SYF1Q04048 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.3■□□□□ 0.52
SYF1Q04048 RRN5YLR141W 1092 nt18.09■□□□□ 0.49
SYF1Q04048 YBR190WYBR190W 312 nt18.08■□□□□ 0.48
SYF1Q04048 RVS167YDR388W 1449 nt18.06■□□□□ 0.48
SYF1Q04048 RSB1YOR049C 1065 nt17.86■□□□□ 0.45
SYF1Q04048 RTC3YHR087W 336 nt17.78■□□□□ 0.44
SYF1Q04048 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.71■□□□□ 0.43
SYF1Q04048 PST2YDR032C 597 nt17.67■□□□□ 0.42
SYF1Q04048 YDJ1YNL064C 1230 nt17.65■□□□□ 0.42
SYF1Q04048 SHR5YOL110W 714 nt17.52■□□□□ 0.4
SYF1Q04048 GAR1YHR089C 618 nt17.27■□□□□ 0.36
SYF1Q04048 YKL097CYKL097C 411 nt17.23■□□□□ 0.35
SYF1Q04048 DEP1YAL013W 1218 nt16.95■□□□□ 0.3
SYF1Q04048 SHU1YHL006C 453 nt16.86■□□□□ 0.29
SYF1Q04048 URN1YPR152C 1398 nt16.78■□□□□ 0.28
SYF1Q04048 YNL208WYNL208W 600 nt16.68■□□□□ 0.26
SYF1Q04048 TIR1YER011W 765 nt16.63■□□□□ 0.25
SYF1Q04048 RPN10YHR200W 807 nt16.62■□□□□ 0.25
SYF1Q04048 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.51■□□□□ 0.23
SYF1Q04048 YOR139CYOR139C 393 nt16.44■□□□□ 0.22
SYF1Q04048 OPI9YLR338W 858 nt16.41■□□□□ 0.22
SYF1Q04048 SSA1YAL005C 1929 nt16.33■□□□□ 0.2
SYF1Q04048 NPL3YDR432W 1245 nt16.23■□□□□ 0.19
SYF1Q04048 SAH1YER043C 1350 nt16.22■□□□□ 0.19
SYF1Q04048 SRB2YHR041C 633 nt16.14■□□□□ 0.17
SYF1Q04048 PUT4YOR348C 1884 nt16.04■□□□□ 0.16
SYF1Q04048 YJR018WYJR018W 363 nt16.04■□□□□ 0.16
SYF1Q04048 WWM1YFL010C 636 nt16■□□□□ 0.15
SYF1Q04048 MNP1YGL068W 585 nt15.99■□□□□ 0.15
SYF1Q04048 YGR021WYGR021W 873 nt15.99■□□□□ 0.15
SYF1Q04048 HOM6YJR139C 1080 nt15.97■□□□□ 0.15
SYF1Q04048 PUN1YLR414C 792 nt15.95■□□□□ 0.14
SYF1Q04048 ARE1YCR048W 1833 nt15.91■□□□□ 0.14
SYF1Q04048 YOL037CYOL037C 354 nt15.86■□□□□ 0.13
SYF1Q04048 RPP2BYDR382W 333 nt15.84■□□□□ 0.13
SYF1Q04048 YJR120WYJR120W 351 nt15.84■□□□□ 0.13
SYF1Q04048 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SYF1Q04048 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SYF1Q04048 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SYF1Q04048 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SYF1Q04048 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.78■□□□□ 0.12
SYF1Q04048 RKM5YLR137W 1104 nt15.74■□□□□ 0.11
SYF1Q04048 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.72■□□□□ 0.11
SYF1Q04048 PTC2YER089C 1395 nt15.7■□□□□ 0.1
SYF1Q04048 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.69■□□□□ 0.1
SYF1Q04048 POA1YBR022W 534 nt15.65■□□□□ 0.1
SYF1Q04048 BDH2YAL061W 1254 nt15.58■□□□□ 0.08
SYF1Q04048 PUS2YGL063W 1113 nt15.54■□□□□ 0.08
SYF1Q04048 SSA3YBL075C 1950 nt15.53■□□□□ 0.08
SYF1Q04048 YLR281CYLR281C 468 nt15.48■□□□□ 0.07
SYF1Q04048 BUD23YCR047C 828 nt15.46■□□□□ 0.07
SYF1Q04048 LSM3YLR438C-A 270 nt15.46■□□□□ 0.07
SYF1Q04048 NAB2YGL122C 1578 nt15.41■□□□□ 0.06
SYF1Q04048 INM2YDR287W 879 nt15.4■□□□□ 0.06
SYF1Q04048 WHI5YOR083W 888 nt15.39■□□□□ 0.05
SYF1Q04048 FPR4YLR449W 1179 nt15.35■□□□□ 0.05
SYF1Q04048 MOT3YMR070W 1473 nt15.33■□□□□ 0.05
SYF1Q04048 YBL100CYBL100C 315 nt15.32■□□□□ 0.04
SYF1Q04048 DAL1YIR027C 1383 nt15.29■□□□□ 0.04
SYF1Q04048 TRM9YML014W 840 nt15.25■□□□□ 0.03
SYF1Q04048 FIS1YIL065C 468 nt15.19■□□□□ 0.02
SYF1Q04048 BSC6YOL137W 1494 nt15.18■□□□□ 0.02
SYF1Q04048 FUN26YAL022C 1554 nt15.16■□□□□ 0.02
SYF1Q04048 PHO4YFR034C 939 nt15.14■□□□□ 0.01
SYF1Q04048 FMP45YDL222C 930 nt15.13■□□□□ 0.01
SYF1Q04048 YPR011CYPR011C 981 nt15.12■□□□□ 0.01
SYF1Q04048 DSK2YMR276W 1122 nt15.1■□□□□ 0.01
SYF1Q04048 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.03■□□□□ -0
SYF1Q04048 YLR236CYLR236C 324 nt15.02■□□□□ -0
SYF1Q04048 CCT6YDR188W 1641 nt15□□□□□ -0.01
SYF1Q04048 IMP2'YIL154C 1041 nt15□□□□□ -0.01
SYF1Q04048 YCH1YGR203W 447 nt14.98□□□□□ -0.01
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