Protein–RNA interactions for Protein: Q05899

YLR297W, Uncharacterized vacuolar protein YLR297W, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR297WQ05899 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.07■■□□□ 1.12
YLR297WQ05899 NSR1YGR159C 1245 nt22■■□□□ 1.11
YLR297WQ05899 NOP1YDL014W 984 nt21.39■■□□□ 1.01
YLR297WQ05899 MDJ1YFL016C 1536 nt19.66■□□□□ 0.74
YLR297WQ05899 YKL036CYKL036C 393 nt19.65■□□□□ 0.74
YLR297WQ05899 Q0297Q0297 156 nt18.69■□□□□ 0.58
YLR297WQ05899 SRX1YKL086W 384 nt18.69■□□□□ 0.58
YLR297WQ05899 YJL027CYJL027C 417 nt18.33■□□□□ 0.52
YLR297WQ05899 SCS3YGL126W 1143 nt17.83■□□□□ 0.44
YLR297WQ05899 YCR051WYCR051W 669 nt17.75■□□□□ 0.43
YLR297WQ05899 DBP2YNL112W 1641 nt17.34■□□□□ 0.37
YLR297WQ05899 YOL085CYOL085C 342 nt17.03■□□□□ 0.32
YLR297WQ05899 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.96■□□□□ 0.31
YLR297WQ05899 CCC1YLR220W 969 nt16.84■□□□□ 0.29
YLR297WQ05899 PKP1YIL042C 1185 nt16.82■□□□□ 0.28
YLR297WQ05899 RPP1BYDL130W 321 nt16.78■□□□□ 0.28
YLR297WQ05899 YBR190WYBR190W 312 nt16.76■□□□□ 0.27
YLR297WQ05899 RTC3YHR087W 336 nt16.42■□□□□ 0.22
YLR297WQ05899 RVS167YDR388W 1449 nt16.26■□□□□ 0.19
YLR297WQ05899 SCJ1YMR214W 1134 nt16.18■□□□□ 0.18
YLR297WQ05899 PET122YER153C 765 nt16.06■□□□□ 0.16
YLR297WQ05899 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.02■□□□□ 0.16
YLR297WQ05899 ATS1YAL020C 1002 nt15.92■□□□□ 0.14
YLR297WQ05899 SCR1SCR1 522 nt15.84■□□□□ 0.13
YLR297WQ05899 SHR5YOL110W 714 nt15.68■□□□□ 0.1
YLR297WQ05899 RRN5YLR141W 1092 nt15.6■□□□□ 0.09
YLR297WQ05899 YDJ1YNL064C 1230 nt15.49■□□□□ 0.07
YLR297WQ05899 URN1YPR152C 1398 nt15.33■□□□□ 0.04
YLR297WQ05899 DEP1YAL013W 1218 nt15.32■□□□□ 0.04
YLR297WQ05899 PUT4YOR348C 1884 nt15.3■□□□□ 0.04
YLR297WQ05899 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.28■□□□□ 0.04
YLR297WQ05899 RSB1YOR049C 1065 nt15.24■□□□□ 0.03
YLR297WQ05899 GAR1YHR089C 618 nt15.19■□□□□ 0.02
YLR297WQ05899 OPI9YLR338W 858 nt15.11■□□□□ 0.01
YLR297WQ05899 SAH1YER043C 1350 nt15.07■□□□□ 0
YLR297WQ05899 RPN10YHR200W 807 nt15.04■□□□□ -0
YLR297WQ05899 YNL208WYNL208W 600 nt15.02■□□□□ -0
YLR297WQ05899 ARE1YCR048W 1833 nt15.01□□□□□ -0.01
YLR297WQ05899 POA1YBR022W 534 nt14.85□□□□□ -0.03
YLR297WQ05899 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.82□□□□□ -0.04
YLR297WQ05899 PST2YDR032C 597 nt14.77□□□□□ -0.05
YLR297WQ05899 TIR1YER011W 765 nt14.68□□□□□ -0.06
YLR297WQ05899 PUN1YLR414C 792 nt14.66□□□□□ -0.06
YLR297WQ05899 YJR018WYJR018W 363 nt14.61□□□□□ -0.07
YLR297WQ05899 BSC6YOL137W 1494 nt14.53□□□□□ -0.08
YLR297WQ05899 SSA1YAL005C 1929 nt14.53□□□□□ -0.08
YLR297WQ05899 PTC2YER089C 1395 nt14.52□□□□□ -0.08
YLR297WQ05899 BUD23YCR047C 828 nt14.49□□□□□ -0.09
YLR297WQ05899 SSA3YBL075C 1950 nt14.46□□□□□ -0.09
YLR297WQ05899 YJR120WYJR120W 351 nt14.37□□□□□ -0.11
YLR297WQ05899 NAB2YGL122C 1578 nt14.33□□□□□ -0.12
YLR297WQ05899 SRB2YHR041C 633 nt14.29□□□□□ -0.12
YLR297WQ05899 RPP2BYDR382W 333 nt14.27□□□□□ -0.13
YLR297WQ05899 SHU1YHL006C 453 nt14.2□□□□□ -0.14
YLR297WQ05899 FPR4YLR449W 1179 nt14.13□□□□□ -0.15
YLR297WQ05899 DAL1YIR027C 1383 nt14.12□□□□□ -0.15
YLR297WQ05899 FIS1YIL065C 468 nt14.12□□□□□ -0.15
YLR297WQ05899 YKL097CYKL097C 411 nt14.12□□□□□ -0.15
YLR297WQ05899 INM2YDR287W 879 nt14.09□□□□□ -0.15
YLR297WQ05899 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.05□□□□□ -0.16
YLR297WQ05899 WWM1YFL010C 636 nt14.03□□□□□ -0.16
YLR297WQ05899 PHO4YFR034C 939 nt14□□□□□ -0.17
YLR297WQ05899 BDH2YAL061W 1254 nt13.98□□□□□ -0.17
YLR297WQ05899 YBL100CYBL100C 315 nt13.95□□□□□ -0.18
YLR297WQ05899 YGR021WYGR021W 873 nt13.88□□□□□ -0.19
YLR297WQ05899 SPT5YML010W 3192 nt13.87□□□□□ -0.19
YLR297WQ05899 HOM6YJR139C 1080 nt13.84□□□□□ -0.19
YLR297WQ05899 FUN26YAL022C 1554 nt13.78□□□□□ -0.2
YLR297WQ05899 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.77□□□□□ -0.21
YLR297WQ05899 MNP1YGL068W 585 nt13.77□□□□□ -0.21
YLR297WQ05899 LSM3YLR438C-A 270 nt13.76□□□□□ -0.21
YLR297WQ05899 YPS1YLR120C 1710 nt13.75□□□□□ -0.21
YLR297WQ05899 TRM9YML014W 840 nt13.74□□□□□ -0.21
YLR297WQ05899 YDR095CYDR095C 411 nt13.65□□□□□ -0.22
YLR297WQ05899 MEP2YNL142W 1500 nt13.64□□□□□ -0.23
YLR297WQ05899 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.63□□□□□ -0.23
YLR297WQ05899 RKM5YLR137W 1104 nt13.63□□□□□ -0.23
YLR297WQ05899 ALF1YNL148C 765 nt13.61□□□□□ -0.23
YLR297WQ05899 YOR139CYOR139C 393 nt13.59□□□□□ -0.23
YLR297WQ05899 CCT6YDR188W 1641 nt13.59□□□□□ -0.23
YLR297WQ05899 NPL3YDR432W 1245 nt13.48□□□□□ -0.25
YLR297WQ05899 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.47□□□□□ -0.25
YLR297WQ05899 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.47□□□□□ -0.25
YLR297WQ05899 YOL037CYOL037C 354 nt13.46□□□□□ -0.25
YLR297WQ05899 DCW1YKL046C 1350 nt13.45□□□□□ -0.26
YLR297WQ05899 SSA4YER103W 1929 nt13.43□□□□□ -0.26
YLR297WQ05899 RPP2AYOL039W 321 nt13.4□□□□□ -0.26
YLR297WQ05899 SIS1YNL007C 1059 nt13.39□□□□□ -0.27
YLR297WQ05899 PTP1YDL230W 1008 nt13.37□□□□□ -0.27
YLR297WQ05899 CAC2YML102W 1407 nt13.29□□□□□ -0.28
YLR297WQ05899 EMI2YDR516C 1503 nt13.27□□□□□ -0.29
YLR297WQ05899 ART5YGR068C 1761 nt13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms