Protein–RNA interactions for Protein: P53094
MDS3, Negative regulator of sporulation MDS3, yeast
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (RIP-Chip) |
Gene |
UniProt Accession |
Gene |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
Detected Interaction |
MDS3 | P53094 | YML009W-B | YML009W-B | 477 nt | | 35,19 | ■■■■□ 3,22 | |
MDS3 | P53094 | NOP1 | YDL014W | 984 nt | | 34,17 | ■■■■□ 3,06 | |
MDS3 | P53094 | NSR1 | YGR159C | 1245 nt | | 33,44 | ■■■□□ 2,94 | |
MDS3 | P53094 | YKL036C | YKL036C | 393 nt | | 32,83 | ■■■□□ 2,85 | |
MDS3 | P53094 | YJL027C | YJL027C | 417 nt | | 30,89 | ■■■□□ 2,54 | |
MDS3 | P53094 | SCS3 | YGL126W | 1143 nt | | 30,68 | ■■■□□ 2,5 | |
MDS3 | P53094 | Q0297 | Q0297 | 156 nt | | 30,39 | ■■■□□ 2,46 | |
MDS3 | P53094 | SRX1 | YKL086W | 384 nt | | 30,05 | ■■■□□ 2,4 | |
MDS3 | P53094 | MDJ1 | YFL016C | 1536 nt | | 29,2 | ■■■□□ 2,26 | |
MDS3 | P53094 | YCR051W | YCR051W | 669 nt | | 28,73 | ■■■□□ 2,19 | |
MDS3 | P53094 | YOL085C | YOL085C | 342 nt | | 28,34 | ■■■□□ 2,13 | |
MDS3 | P53094 | SCJ1 | YMR214W | 1134 nt | | 28,17 | ■■■□□ 2,1 | |
MDS3 | P53094 | PKP1 | YIL042C | 1185 nt | | 28,08 | ■■■□□ 2,09 | |
MDS3 | P53094 | ATS1 | YAL020C | 1002 nt | | 27,51 | ■■□□□ 1,99 | |
MDS3 | P53094 | RPP1B | YDL130W | 321 nt | | 27,31 | ■■□□□ 1,96 | |
MDS3 | P53094 | TRN1 | tP(UGG)A | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | SUF9 | tP(UGG)F | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | SUF8 | tP(UGG)H | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | tP(UGG)L | tP(UGG)L | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | SUF7 | tP(UGG)M | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | tP(UGG)N1 | tP(UGG)N1 | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | tP(UGG)N2 | tP(UGG)N2 | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | tP(UGG)O1 | tP(UGG)O1 | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | SUF11 | tP(UGG)O2 | 72 nt | | 26,65 | ■■□□□ 1,86 | |
MDS3 | P53094 | CCC1 | YLR220W | 969 nt | | 26,37 | ■■□□□ 1,81 | |
MDS3 | P53094 | PET122 | YER153C | 765 nt | | 26,21 | ■■□□□ 1,79 | |
MDS3 | P53094 | DBP2 | YNL112W | 1641 nt | | 26,12 | ■■□□□ 1,77 | |
MDS3 | P53094 | SCR1 | SCR1 | 522 nt | | 25,98 | ■■□□□ 1,75 | |
MDS3 | P53094 | RTC3 | YHR087W | 336 nt | | 25,92 | ■■□□□ 1,74 | |
MDS3 | P53094 | tP(UGG)O3 | tP(UGG)O3 | 72 nt | | 25,49 | ■■□□□ 1,67 | |
MDS3 | P53094 | RRN5 | YLR141W | 1092 nt | | 25,34 | ■■□□□ 1,65 | |
MDS3 | P53094 | RSB1 | YOR049C | 1065 nt | | 25,34 | ■■□□□ 1,65 | |
MDS3 | P53094 | PST2 | YDR032C | 597 nt | | 25,21 | ■■□□□ 1,63 | |
MDS3 | P53094 | YKL097C | YKL097C | 411 nt | | 25,01 | ■■□□□ 1,59 | |
MDS3 | P53094 | YER088W-B | YER088W-B | 147 nt | | 24,89 | ■■□□□ 1,58 | |
MDS3 | P53094 | RVS167 | YDR388W | 1449 nt | | 24,66 | ■■□□□ 1,54 | |
MDS3 | P53094 | YDJ1 | YNL064C | 1230 nt | | 24,48 | ■■□□□ 1,51 | |
MDS3 | P53094 | SHU1 | YHL006C | 453 nt | | 24,17 | ■■□□□ 1,46 | |
MDS3 | P53094 | YBR190W | YBR190W | 312 nt | | 24,16 | ■■□□□ 1,46 | |
MDS3 | P53094 | SHR5 | YOL110W | 714 nt | | 24,13 | ■■□□□ 1,45 | |
MDS3 | P53094 | GAR1 | YHR089C | 618 nt | | 23,97 | ■■□□□ 1,43 | |
MDS3 | P53094 | YOR139C | YOR139C | 393 nt | | 23,88 | ■■□□□ 1,41 | |
MDS3 | P53094 | YAL037C-B | YAL037C-B | 975 nt | | 23,52 | ■■□□□ 1,36 | |
MDS3 | P53094 | NPL3 | YDR432W | 1245 nt | | 23,36 | ■■□□□ 1,33 | |
MDS3 | P53094 | DEP1 | YAL013W | 1218 nt | | 23,3 | ■■□□□ 1,32 | |
MDS3 | P53094 | TIR1 | YER011W | 765 nt | | 23,06 | ■■□□□ 1,28 | |
MDS3 | P53094 | MNP1 | YGL068W | 585 nt | | 22,91 | ■■□□□ 1,26 | |
MDS3 | P53094 | URN1 | YPR152C | 1398 nt | | 22,85 | ■■□□□ 1,25 | |
MDS3 | P53094 | SRB2 | YHR041C | 633 nt | | 22,73 | ■■□□□ 1,23 | |
MDS3 | P53094 | YNL208W | YNL208W | 600 nt | | 22,73 | ■■□□□ 1,23 | |
MDS3 | P53094 | RPN10 | YHR200W | 807 nt | | 22,69 | ■■□□□ 1,22 | |
MDS3 | P53094 | YOL037C | YOL037C | 354 nt | | 22,66 | ■■□□□ 1,22 | |
MDS3 | P53094 | tM(CAU)C | tM(CAU)C | 72 nt | | 22,64 | ■■□□□ 1,21 | |
MDS3 | P53094 | IMT4 | tM(CAU)E | 72 nt | | 22,64 | ■■□□□ 1,21 | |
MDS3 | P53094 | IMT3 | tM(CAU)J3 | 72 nt | | 22,64 | ■■□□□ 1,21 | |
MDS3 | P53094 | IMT1 | tM(CAU)O1 | 72 nt | | 22,64 | ■■□□□ 1,21 | |
MDS3 | P53094 | IMT2 | tM(CAU)P | 72 nt | | 22,64 | ■■□□□ 1,21 | |
MDS3 | P53094 | SSA1 | YAL005C | 1929 nt | | 22,62 | ■■□□□ 1,21 | |
MDS3 | P53094 | HOM6 | YJR139C | 1080 nt | | 22,51 | ■■□□□ 1,19 | |
MDS3 | P53094 | MOT3 | YMR070W | 1473 nt | | 22,44 | ■■□□□ 1,18 | |
MDS3 | P53094 | YGR021W | YGR021W | 873 nt | | 22,41 | ■■□□□ 1,18 | |
MDS3 | P53094 | BSC6 | YOL137W | 1494 nt | | 22,39 | ■■□□□ 1,18 | |
MDS3 | P53094 | WWM1 | YFL010C | 636 nt | | 22,37 | ■■□□□ 1,17 | |
MDS3 | P53094 | RKM5 | YLR137W | 1104 nt | | 22,18 | ■■□□□ 1,14 | |
MDS3 | P53094 | PUS2 | YGL063W | 1113 nt | | 22,15 | ■■□□□ 1,14 | |
MDS3 | P53094 | OPI9 | YLR338W | 858 nt | | 22,11 | ■■□□□ 1,13 | |
MDS3 | P53094 | YJR120W | YJR120W | 351 nt | | 21,96 | ■■□□□ 1,11 | |
MDS3 | P53094 | YLR281C | YLR281C | 468 nt | | 21,9 | ■■□□□ 1,1 | |
MDS3 | P53094 | SAH1 | YER043C | 1350 nt | | 21,85 | ■■□□□ 1,09 | |
MDS3 | P53094 | YFL021C-A | YFL021C-A | 855 nt | | 21,83 | ■■□□□ 1,08 | |
MDS3 | P53094 | FMP45 | YDL222C | 930 nt | | 21,77 | ■■□□□ 1,08 | |
MDS3 | P53094 | YJR018W | YJR018W | 363 nt | | 21,75 | ■■□□□ 1,07 | |
MDS3 | P53094 | WHI5 | YOR083W | 888 nt | | 21,73 | ■■□□□ 1,07 | |
MDS3 | P53094 | UBX6 | YJL048C | 1191 nt | | 21,67 | ■■□□□ 1,06 | |
MDS3 | P53094 | MRPL8 | YJL063C | 717 nt | | 21,67 | ■■□□□ 1,06 | |
MDS3 | P53094 | YLR236C | YLR236C | 324 nt | | 21,66 | ■■□□□ 1,06 | |
MDS3 | P53094 | SSA3 | YBL075C | 1950 nt | | 21,65 | ■■□□□ 1,06 | |
MDS3 | P53094 | RPP2B | YDR382W | 333 nt | | 21,55 | ■■□□□ 1,04 | |
MDS3 | P53094 | YPR011C | YPR011C | 981 nt | | 21,55 | ■■□□□ 1,04 | |
MDS3 | P53094 | PUN1 | YLR414C | 792 nt | | 21,46 | ■■□□□ 1,03 | |
MDS3 | P53094 | DSK2 | YMR276W | 1122 nt | | 21,45 | ■■□□□ 1,03 | |
MDS3 | P53094 | YCH1 | YGR203W | 447 nt | | 21,41 | ■■□□□ 1,02 | |
MDS3 | P53094 | BDH2 | YAL061W | 1254 nt | | 21,39 | ■■□□□ 1,01 | |
MDS3 | P53094 | YEL076C-A | YEL076C-A | 651 nt | | 21,31 | ■■□□□ 1 | |
MDS3 | P53094 | YEL076C | YEL076C | 651 nt | | 21,31 | ■■□□□ 1 | |
MDS3 | P53094 | ADO1 | YJR105W | 1023 nt | | 21,31 | ■■□□□ 1 | |
MDS3 | P53094 | YLR464W | YLR464W | 651 nt | | 21,31 | ■■□□□ 1 | |
MDS3 | P53094 | ARE1 | YCR048W | 1833 nt | | 21,24 | ■□□□□ 0,99 | |
MDS3 | P53094 | SPP1 | YPL138C | 1062 nt | | 21,2 | ■□□□□ 0,98 | |
MDS3 | P53094 | PUT4 | YOR348C | 1884 nt | | 21,19 | ■□□□□ 0,98 | |
MDS3 | P53094 | YHR049C-A | YHR049C-A | 297 nt | | 21,18 | ■□□□□ 0,98 | |
MDS3 | P53094 | RTG1 | YOL067C | 534 nt | | 21,15 | ■□□□□ 0,98 | |
MDS3 | P53094 | LPX1 | YOR084W | 1164 nt | | 21,14 | ■□□□□ 0,98 | |
MDS3 | P53094 | LSM3 | YLR438C-A | 270 nt | | 21,07 | ■□□□□ 0,96 | |
MDS3 | P53094 | IMP2' | YIL154C | 1041 nt | | 21,06 | ■□□□□ 0,96 | |
MDS3 | P53094 | PTC2 | YER089C | 1395 nt | | 21,06 | ■□□□□ 0,96 | |
MDS3 | P53094 | YLR154C-G | YLR154C-G | 150 nt | | 20,97 | ■□□□□ 0,95 | |
MDS3 | P53094 | YBL100C | YBL100C | 315 nt | | 20,94 | ■□□□□ 0,94 | |
MDS3 | P53094 | YFL015W-A | YFL015W-A | 318 nt | | 20,93 | ■□□□□ 0,94 | |
MDS3 | P53094 | ERV46 | YAL042W | 1248 nt | | 20,82 | ■□□□□ 0,92 | |
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