Protein–RNA interactions for Protein: P53094

MDS3, Negative regulator of sporulation MDS3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3P53094 YML009W-BYML009W-B 477 nt35,19■■■■□ 3,22
MDS3P53094 NOP1YDL014W 984 nt34,17■■■■□ 3,06
MDS3P53094 NSR1YGR159C 1245 nt33,44■■■□□ 2,94
MDS3P53094 YKL036CYKL036C 393 nt32,83■■■□□ 2,85
MDS3P53094 YJL027CYJL027C 417 nt30,89■■■□□ 2,54
MDS3P53094 SCS3YGL126W 1143 nt30,68■■■□□ 2,5
MDS3P53094 Q0297Q0297 156 nt30,39■■■□□ 2,46
MDS3P53094 SRX1YKL086W 384 nt30,05■■■□□ 2,4
MDS3P53094 MDJ1YFL016C 1536 nt29,2■■■□□ 2,26
MDS3P53094 YCR051WYCR051W 669 nt28,73■■■□□ 2,19
MDS3P53094 YOL085CYOL085C 342 nt28,34■■■□□ 2,13
MDS3P53094 SCJ1YMR214W 1134 nt28,17■■■□□ 2,1
MDS3P53094 PKP1YIL042C 1185 nt28,08■■■□□ 2,09
MDS3P53094 ATS1YAL020C 1002 nt27,51■■□□□ 1,99
MDS3P53094 RPP1BYDL130W 321 nt27,31■■□□□ 1,96
MDS3P53094 TRN1tP(UGG)A 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 SUF9tP(UGG)F 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 SUF8tP(UGG)H 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 SUF7tP(UGG)M 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 SUF11tP(UGG)O2 72 nt26,65■■□□□ 1,86
MDS3P53094 CCC1YLR220W 969 nt26,37■■□□□ 1,81
MDS3P53094 PET122YER153C 765 nt26,21■■□□□ 1,79
MDS3P53094 DBP2YNL112W 1641 nt26,12■■□□□ 1,77
MDS3P53094 SCR1SCR1 522 nt25,98■■□□□ 1,75
MDS3P53094 RTC3YHR087W 336 nt25,92■■□□□ 1,74
MDS3P53094 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt25,49■■□□□ 1,67
MDS3P53094 RRN5YLR141W 1092 nt25,34■■□□□ 1,65
MDS3P53094 RSB1YOR049C 1065 nt25,34■■□□□ 1,65
MDS3P53094 PST2YDR032C 597 nt25,21■■□□□ 1,63
MDS3P53094 YKL097CYKL097C 411 nt25,01■■□□□ 1,59
MDS3P53094 YER088W-BYER088W-B 147 nt24,89■■□□□ 1,58
MDS3P53094 RVS167YDR388W 1449 nt24,66■■□□□ 1,54
MDS3P53094 YDJ1YNL064C 1230 nt24,48■■□□□ 1,51
MDS3P53094 SHU1YHL006C 453 nt24,17■■□□□ 1,46
MDS3P53094 YBR190WYBR190W 312 nt24,16■■□□□ 1,46
MDS3P53094 SHR5YOL110W 714 nt24,13■■□□□ 1,45
MDS3P53094 GAR1YHR089C 618 nt23,97■■□□□ 1,43
MDS3P53094 YOR139CYOR139C 393 nt23,88■■□□□ 1,41
MDS3P53094 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt23,52■■□□□ 1,36
MDS3P53094 NPL3YDR432W 1245 nt23,36■■□□□ 1,33
MDS3P53094 DEP1YAL013W 1218 nt23,3■■□□□ 1,32
MDS3P53094 TIR1YER011W 765 nt23,06■■□□□ 1,28
MDS3P53094 MNP1YGL068W 585 nt22,91■■□□□ 1,26
MDS3P53094 URN1YPR152C 1398 nt22,85■■□□□ 1,25
MDS3P53094 SRB2YHR041C 633 nt22,73■■□□□ 1,23
MDS3P53094 YNL208WYNL208W 600 nt22,73■■□□□ 1,23
MDS3P53094 RPN10YHR200W 807 nt22,69■■□□□ 1,22
MDS3P53094 YOL037CYOL037C 354 nt22,66■■□□□ 1,22
MDS3P53094 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt22,64■■□□□ 1,21
MDS3P53094 IMT4tM(CAU)E 72 nt22,64■■□□□ 1,21
MDS3P53094 IMT3tM(CAU)J3 72 nt22,64■■□□□ 1,21
MDS3P53094 IMT1tM(CAU)O1 72 nt22,64■■□□□ 1,21
MDS3P53094 IMT2tM(CAU)P 72 nt22,64■■□□□ 1,21
MDS3P53094 SSA1YAL005C 1929 nt22,62■■□□□ 1,21
MDS3P53094 HOM6YJR139C 1080 nt22,51■■□□□ 1,19
MDS3P53094 MOT3YMR070W 1473 nt22,44■■□□□ 1,18
MDS3P53094 YGR021WYGR021W 873 nt22,41■■□□□ 1,18
MDS3P53094 BSC6YOL137W 1494 nt22,39■■□□□ 1,18
MDS3P53094 WWM1YFL010C 636 nt22,37■■□□□ 1,17
MDS3P53094 RKM5YLR137W 1104 nt22,18■■□□□ 1,14
MDS3P53094 PUS2YGL063W 1113 nt22,15■■□□□ 1,14
MDS3P53094 OPI9YLR338W 858 nt22,11■■□□□ 1,13
MDS3P53094 YJR120WYJR120W 351 nt21,96■■□□□ 1,11
MDS3P53094 YLR281CYLR281C 468 nt21,9■■□□□ 1,1
MDS3P53094 SAH1YER043C 1350 nt21,85■■□□□ 1,09
MDS3P53094 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt21,83■■□□□ 1,08
MDS3P53094 FMP45YDL222C 930 nt21,77■■□□□ 1,08
MDS3P53094 YJR018WYJR018W 363 nt21,75■■□□□ 1,07
MDS3P53094 WHI5YOR083W 888 nt21,73■■□□□ 1,07
MDS3P53094 UBX6YJL048C 1191 nt21,67■■□□□ 1,06
MDS3P53094 MRPL8YJL063C 717 nt21,67■■□□□ 1,06
MDS3P53094 YLR236CYLR236C 324 nt21,66■■□□□ 1,06
MDS3P53094 SSA3YBL075C 1950 nt21,65■■□□□ 1,06
MDS3P53094 RPP2BYDR382W 333 nt21,55■■□□□ 1,04
MDS3P53094 YPR011CYPR011C 981 nt21,55■■□□□ 1,04
MDS3P53094 PUN1YLR414C 792 nt21,46■■□□□ 1,03
MDS3P53094 DSK2YMR276W 1122 nt21,45■■□□□ 1,03
MDS3P53094 YCH1YGR203W 447 nt21,41■■□□□ 1,02
MDS3P53094 BDH2YAL061W 1254 nt21,39■■□□□ 1,01
MDS3P53094 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt21,31■■□□□ 1
MDS3P53094 YEL076CYEL076C 651 nt21,31■■□□□ 1
MDS3P53094 ADO1YJR105W 1023 nt21,31■■□□□ 1
MDS3P53094 YLR464WYLR464W 651 nt21,31■■□□□ 1
MDS3P53094 ARE1YCR048W 1833 nt21,24■□□□□ 0,99
MDS3P53094 SPP1YPL138C 1062 nt21,2■□□□□ 0,98
MDS3P53094 PUT4YOR348C 1884 nt21,19■□□□□ 0,98
MDS3P53094 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt21,18■□□□□ 0,98
MDS3P53094 RTG1YOL067C 534 nt21,15■□□□□ 0,98
MDS3P53094 LPX1YOR084W 1164 nt21,14■□□□□ 0,98
MDS3P53094 LSM3YLR438C-A 270 nt21,07■□□□□ 0,96
MDS3P53094 IMP2'YIL154C 1041 nt21,06■□□□□ 0,96
MDS3P53094 PTC2YER089C 1395 nt21,06■□□□□ 0,96
MDS3P53094 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt20,97■□□□□ 0,95
MDS3P53094 YBL100CYBL100C 315 nt20,94■□□□□ 0,94
MDS3P53094 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt20,93■□□□□ 0,94
MDS3P53094 ERV46YAL042W 1248 nt20,82■□□□□ 0,92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16,8 ms