Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y606

PUS1, tRNA pseudouridine synthase A, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1Q9Y606 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.541e-323■■■■■ 240.9
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PUS1Q9Y606 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.61e-323■■■■■ 170.8
PUS1Q9Y606 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.691e-323■■■■■ 146.1
PUS1Q9Y606 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.064e-60■■■■■ 137.8
PUS1Q9Y606 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.814e-60■■■■■ 137.8
PUS1Q9Y606 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.311e-323■■■■■ 132.6
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PUS1Q9Y606 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt8.51□□□□□ -1.051e-26■■■■■ 120
PUS1Q9Y606 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt8.5□□□□□ -1.051e-26■■■■■ 120
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PUS1Q9Y606 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-15■■■■■ 116.3
PUS1Q9Y606 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.761e-28■■■■■ 67.8
PUS1Q9Y606 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 66.3
PUS1Q9Y606 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 66.3
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PUS1Q9Y606 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.171e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.161e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-218ENST00000606525 2010 ntTSL 215.57■□□□□ 0.081e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-209ENST00000483813 1277 ntTSL 515.34■□□□□ 0.051e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 515.25■□□□□ 0.031e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 514.66□□□□□ -0.061e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PLCD3-201ENST00000538093 546 ntTSL 414.3□□□□□ -0.121e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PLCD3-206ENST00000544446 503 ntTSL 413.75□□□□□ -0.211e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 PTK2-219ENST00000520045 602 ntTSL 413.51□□□□□ -0.251e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.321e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 PLCD3-208ENST00000590644 595 ntTSL 412.45□□□□□ -0.421e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 NECAB3-204ENST00000463246 766 ntTSL 312.2□□□□□ -0.461e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 KCNAB2-211ENST00000445501 486 ntTSL 411.39□□□□□ -0.591e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 CMIP-206ENST00000565029 1559 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.591e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 TFAP4-203ENST00000573476 785 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.251e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 37.18□□□□□ -1.261e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.31e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.351e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 36.57□□□□□ -1.361e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-248ENST00000523675 650 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.451e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 45.83□□□□□ -1.481e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-205ENST00000517453 571 ntTSL 45.82□□□□□ -1.481e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-232ENST00000521395 540 ntTSL 45.73□□□□□ -1.491e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 45.69□□□□□ -1.51e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 45.68□□□□□ -1.51e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-222ENST00000520475 570 ntTSL 55.66□□□□□ -1.51e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 45.41□□□□□ -1.541e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.591e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 UBAP2L-213ENST00000466173 804 ntTSL 24.74□□□□□ -1.651e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.661e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 34.52□□□□□ -1.691e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 USP10-209ENST00000563433 540 ntTSL 23.42□□□□□ -1.861e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 33.28□□□□□ -1.881e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.991e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.561e-9■■■■■ 44.4
PUS1Q9Y606 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 41.4
PUS1Q9Y606 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 41.4
PUS1Q9Y606 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 44.04□□□□□ -1.761e-8■■■■■ 41.4
PUS1Q9Y606 UBA2-210ENST00000607361 754 ntTSL 218.38■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 37.8
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