Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y606

PUS1, tRNA pseudouridine synthase A, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1Q9Y606 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.541e-323■■■■■ 240.9
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PUS1Q9Y606 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.61e-323■■■■■ 170.8
PUS1Q9Y606 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.691e-323■■■■■ 146.1
PUS1Q9Y606 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.064e-60■■■■■ 137.8
PUS1Q9Y606 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.814e-60■■■■■ 137.8
PUS1Q9Y606 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.311e-323■■■■■ 132.6
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PUS1Q9Y606 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt8.51□□□□□ -1.051e-26■■■■■ 120
PUS1Q9Y606 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt8.5□□□□□ -1.051e-26■■■■■ 120
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PUS1Q9Y606 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-15■■■■■ 116.3
PUS1Q9Y606 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.761e-28■■■■■ 67.8
PUS1Q9Y606 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 66.3
PUS1Q9Y606 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 66.3
PUS1Q9Y606 NECAB3-212ENST00000485976 1016 ntTSL 516.85■□□□□ 0.291e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-207ENST00000478237 827 ntTSL 216.85■□□□□ 0.291e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 216.73■□□□□ 0.271e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.171e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.161e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-218ENST00000606525 2010 ntTSL 215.57■□□□□ 0.081e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 415.54■□□□□ 0.081e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-209ENST00000483813 1277 ntTSL 515.34■□□□□ 0.051e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 515.25■□□□□ 0.031e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 514.66□□□□□ -0.061e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PLCD3-201ENST00000538093 546 ntTSL 414.3□□□□□ -0.121e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PLCD3-206ENST00000544446 503 ntTSL 413.75□□□□□ -0.211e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 PLCD3-208ENST00000590644 595 ntTSL 412.45□□□□□ -0.421e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 CMIP-206ENST00000565029 1559 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.591e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 TFAP4-203ENST00000573476 785 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.251e-5■■■■■ 49.7
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PUS1Q9Y606 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.351e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 36.57□□□□□ -1.361e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-248ENST00000523675 650 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.451e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 45.83□□□□□ -1.481e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-205ENST00000517453 571 ntTSL 45.82□□□□□ -1.481e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-232ENST00000521395 540 ntTSL 45.73□□□□□ -1.491e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 45.69□□□□□ -1.51e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 45.68□□□□□ -1.51e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-222ENST00000520475 570 ntTSL 55.66□□□□□ -1.51e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 45.41□□□□□ -1.541e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.591e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 UBAP2L-213ENST00000466173 804 ntTSL 24.74□□□□□ -1.651e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.661e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 34.52□□□□□ -1.691e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 USP10-209ENST00000563433 540 ntTSL 23.42□□□□□ -1.861e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 33.28□□□□□ -1.881e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.991e-5■■■■■ 49.7
PUS1Q9Y606 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.561e-9■■■■■ 44.4
PUS1Q9Y606 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 41.4
PUS1Q9Y606 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 41.4
PUS1Q9Y606 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 44.04□□□□□ -1.761e-8■■■■■ 41.4
PUS1Q9Y606 UBA2-210ENST00000607361 754 ntTSL 218.38■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 37.8
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