RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.5■■■□□ 2.63
USP10-201ENST00000219473 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.95■■□□□ 1.91
USP10-201ENST00000219473 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.8■■□□□ 1.88
USP10-201ENST00000219473 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.6■■□□□ 1.85
USP10-201ENST00000219473 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
USP10-201ENST00000219473 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
USP10-201ENST00000219473 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.71■■□□□ 1.71
USP10-201ENST00000219473 ABCC9O60706 1549 aa25.36■■□□□ 1.65
USP10-201ENST00000219473 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.29■■□□□ 1.64
USP10-201ENST00000219473 SCRIBQ14160 1630 aa25.29■■□□□ 1.64
USP10-201ENST00000219473 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.08■■□□□ 1.6
USP10-201ENST00000219473 NACADO15069 1562 aa24.91■■□□□ 1.58
USP10-201ENST00000219473 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
USP10-201ENST00000219473 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.69■■□□□ 1.54
USP10-201ENST00000219473 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.64■■□□□ 1.54
USP10-201ENST00000219473 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.6■■□□□ 1.53
USP10-201ENST00000219473 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.53■■□□□ 1.52
USP10-201ENST00000219473 TRIM41Q8WV44 630 aa24.45■■□□□ 1.5
USP10-201ENST00000219473 WIZO95785 1651 aa24.39■■□□□ 1.49
USP10-201ENST00000219473 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
USP10-201ENST00000219473 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.33■■□□□ 1.49
USP10-201ENST00000219473 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.29■■□□□ 1.48
USP10-201ENST00000219473 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
USP10-201ENST00000219473 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
USP10-201ENST00000219473 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.2■■□□□ 1.46
USP10-201ENST00000219473 SMARCA4P51532 1647 aa24.05■■□□□ 1.44
USP10-201ENST00000219473 HRCP23327 699 aa23.98■■□□□ 1.43
USP10-201ENST00000219473 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.93■■□□□ 1.42
USP10-201ENST00000219473 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
USP10-201ENST00000219473 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.9■■□□□ 1.42
USP10-201ENST00000219473 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
USP10-201ENST00000219473 SMARCA2P51531 1590 aa23.81■■□□□ 1.4
USP10-201ENST00000219473 ABCC8Q09428 1581 aa23.8■■□□□ 1.4
USP10-201ENST00000219473 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
USP10-201ENST00000219473 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
USP10-201ENST00000219473 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.54■■□□□ 1.36
USP10-201ENST00000219473 SOGA1O94964 1423 aa23.53■■□□□ 1.36
USP10-201ENST00000219473 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP10-201ENST00000219473 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.49■■□□□ 1.35
USP10-201ENST00000219473 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
USP10-201ENST00000219473 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
USP10-201ENST00000219473 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USP10-201ENST00000219473 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
USP10-201ENST00000219473 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.38■■□□□ 1.33
USP10-201ENST00000219473 CEP162Q5TB80 1403 aa23.26■■□□□ 1.31
USP10-201ENST00000219473 SYNJ1O43426 1573 aa23.26■■□□□ 1.31
USP10-201ENST00000219473 EEA1Q15075 1411 aa23.22■■□□□ 1.31
USP10-201ENST00000219473 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.18■■□□□ 1.3
USP10-201ENST00000219473 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
USP10-201ENST00000219473 GOLGA3Q08378 1498 aa23.12■■□□□ 1.29
USP10-201ENST00000219473 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP10-201ENST00000219473 NCAPD3P42695 1498 aa23.08■■□□□ 1.29
USP10-201ENST00000219473 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
USP10-201ENST00000219473 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.01■■□□□ 1.27
USP10-201ENST00000219473 HMGXB3Q12766 1538 aa23.01■■□□□ 1.27
USP10-201ENST00000219473 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
USP10-201ENST00000219473 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.95■■□□□ 1.26
USP10-201ENST00000219473 TOP2BQ02880 1626 aa22.94■■□□□ 1.26
USP10-201ENST00000219473 CLIP1P30622 1438 aa22.91■■□□□ 1.26
USP10-201ENST00000219473 KIF21BO75037 1637 aa22.89■■□□□ 1.26
USP10-201ENST00000219473 CUX1P39880 1505 aa22.84■■□□□ 1.25
USP10-201ENST00000219473 CFTRP13569 1480 aa22.84■■□□□ 1.25
USP10-201ENST00000219473 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.82■■□□□ 1.24
USP10-201ENST00000219473 APLP2Q06481 763 aa22.79■■□□□ 1.24
USP10-201ENST00000219473 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP10-201ENST00000219473 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.72■■□□□ 1.23
USP10-201ENST00000219473 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-201ENST00000219473 KIF27Q86VH2 1401 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-201ENST00000219473 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-201ENST00000219473 PRXQ9BXM0 1461 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-201ENST00000219473 CUX2O14529 1486 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-201ENST00000219473 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.58■■□□□ 1.2
USP10-201ENST00000219473 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-201ENST00000219473 PRDM2Q13029 1718 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-201ENST00000219473 ARAP1Q96P48 1450 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-201ENST00000219473 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.49■■□□□ 1.19
USP10-201ENST00000219473 NESP48681 1621 aa22.49■■□□□ 1.19
USP10-201ENST00000219473 IGF1RP08069 1367 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-201ENST00000219473 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP10-201ENST00000219473 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-201ENST00000219473 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-201ENST00000219473 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-201ENST00000219473 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-201ENST00000219473 P3H3Q8IVL6 736 aa22.37■■□□□ 1.17
USP10-201ENST00000219473 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP10-201ENST00000219473 ITGAEP38570 1179 aa22.3■■□□□ 1.16
USP10-201ENST00000219473 TOPBP1Q92547 1522 aa22.29■■□□□ 1.16
USP10-201ENST00000219473 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
USP10-201ENST00000219473 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
USP10-201ENST00000219473 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-201ENST00000219473 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP10-201ENST00000219473 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.17■■□□□ 1.14
USP10-201ENST00000219473 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP10-201ENST00000219473 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP10-201ENST00000219473 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.12■■□□□ 1.13
USP10-201ENST00000219473 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
USP10-201ENST00000219473 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-201ENST00000219473 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-201ENST00000219473 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP10-201ENST00000219473 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms