RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577988.2

SNORD3B-1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3B-1, humanhuman

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Gene SNORD3B-1, Length 758 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3B-1-201ENST00000577988 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.45■■■□□ 2.95
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.91■■■□□ 2.06
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.15■■□□□ 1.78
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.99■■□□□ 1.75
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 SMARCA2P51531 1590 aa25.78■■□□□ 1.72
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.76■■□□□ 1.71
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.73■■□□□ 1.71
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.7■■□□□ 1.71
SNORD3B-1-201ENST00000577988 HMGXB3Q12766 1538 aa25.63■■□□□ 1.69
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 CFTRP13569 1480 aa24.88■■□□□ 1.57
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.72■■□□□ 1.55
SNORD3B-1-201ENST00000577988 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.7■■□□□ 1.54
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PRDM2Q13029 1718 aa24.69■■□□□ 1.54
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CUX2O14529 1486 aa24.66■■□□□ 1.54
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.66■■□□□ 1.54
SNORD3B-1-201ENST00000577988 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.6■■□□□ 1.53
SNORD3B-1-201ENST00000577988 WDR62O43379 1518 aa24.51■■□□□ 1.51
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ABCC8Q09428 1581 aa24.42■■□□□ 1.5
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 TOPBP1Q92547 1522 aa24.3■■□□□ 1.48
SNORD3B-1-201ENST00000577988 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.29■■□□□ 1.48
SNORD3B-1-201ENST00000577988 IFT140Q96RY7 1462 aa24.17■■□□□ 1.46
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CUX1P39880 1505 aa24.14■■□□□ 1.45
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.05■■□□□ 1.44
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SOGA1O94964 1423 aa24.04■■□□□ 1.44
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 TOP2BQ02880 1626 aa23.99■■□□□ 1.43
SNORD3B-1-201ENST00000577988 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.99■■□□□ 1.43
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.96■■□□□ 1.43
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SYNJ1O43426 1573 aa23.93■■□□□ 1.42
SNORD3B-1-201ENST00000577988 WDR97A6NE52 1622 aa23.92■■□□□ 1.42
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.87■■□□□ 1.41
SNORD3B-1-201ENST00000577988 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SNORD3B-1-201ENST00000577988 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.79■■□□□ 1.4
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 GRIN2BQ13224 1484 aa23.75■■□□□ 1.39
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.71■■□□□ 1.39
SNORD3B-1-201ENST00000577988 OSCARQ8IYS5 282 aa23.71■■□□□ 1.39
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PBRM1Q86U86 1689 aa23.65■■□□□ 1.38
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.64■■□□□ 1.38
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TRIM41Q8WV44 630 aa23.61■■□□□ 1.37
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.6■■□□□ 1.37
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KIF27Q86VH2 1401 aa23.59■■□□□ 1.37
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SNORD3B-1-201ENST00000577988 FBLN2P98095 1184 aa23.58■■□□□ 1.37
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SYNJ2O15056 1496 aa23.57■■□□□ 1.36
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.51■■□□□ 1.35
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.33■■□□□ 1.32
SNORD3B-1-201ENST00000577988 NUP160Q12769 1436 aa23.33■■□□□ 1.32
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.31■■□□□ 1.32
SNORD3B-1-201ENST00000577988 EEA1Q15075 1411 aa23.26■■□□□ 1.31
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CEP170Q5SW79 1584 aa23.25■■□□□ 1.31
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ARHGEF11O15085 1522 aa23.22■■□□□ 1.31
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.21■■□□□ 1.31
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.2■■□□□ 1.3
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.2■■□□□ 1.3
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.2■■□□□ 1.3
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.2■■□□□ 1.3
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