Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPOCK3Q9BQ16 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPOCK3Q9BQ16 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPOCK3Q9BQ16 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPOCK3Q9BQ16 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPOCK3Q9BQ16 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPOCK3Q9BQ16 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPOCK3Q9BQ16 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPOCK3Q9BQ16 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SPOCK3Q9BQ16 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPOCK3Q9BQ16 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3Q9BQ16 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPOCK3Q9BQ16 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPOCK3Q9BQ16 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPOCK3Q9BQ16 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPOCK3Q9BQ16 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPOCK3Q9BQ16 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPOCK3Q9BQ16 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPOCK3Q9BQ16 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPOCK3Q9BQ16 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPOCK3Q9BQ16 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPOCK3Q9BQ16 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPOCK3Q9BQ16 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPOCK3Q9BQ16 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPOCK3Q9BQ16 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPOCK3Q9BQ16 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SPOCK3Q9BQ16 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPOCK3Q9BQ16 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPOCK3Q9BQ16 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPOCK3Q9BQ16 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPOCK3Q9BQ16 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPOCK3Q9BQ16 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPOCK3Q9BQ16 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPOCK3Q9BQ16 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPOCK3Q9BQ16 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPOCK3Q9BQ16 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOCK3Q9BQ16 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCK3Q9BQ16 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOCK3Q9BQ16 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPOCK3Q9BQ16 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPOCK3Q9BQ16 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPOCK3Q9BQ16 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPOCK3Q9BQ16 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPOCK3Q9BQ16 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPOCK3Q9BQ16 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPOCK3Q9BQ16 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPOCK3Q9BQ16 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPOCK3Q9BQ16 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPOCK3Q9BQ16 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPOCK3Q9BQ16 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPOCK3Q9BQ16 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPOCK3Q9BQ16 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPOCK3Q9BQ16 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPOCK3Q9BQ16 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPOCK3Q9BQ16 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPOCK3Q9BQ16 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPOCK3Q9BQ16 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPOCK3Q9BQ16 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPOCK3Q9BQ16 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPOCK3Q9BQ16 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPOCK3Q9BQ16 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPOCK3Q9BQ16 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPOCK3Q9BQ16 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPOCK3Q9BQ16 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPOCK3Q9BQ16 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPOCK3Q9BQ16 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPOCK3Q9BQ16 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPOCK3Q9BQ16 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPOCK3Q9BQ16 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPOCK3Q9BQ16 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPOCK3Q9BQ16 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPOCK3Q9BQ16 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPOCK3Q9BQ16 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPOCK3Q9BQ16 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPOCK3Q9BQ16 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPOCK3Q9BQ16 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPOCK3Q9BQ16 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPOCK3Q9BQ16 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPOCK3Q9BQ16 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOCK3Q9BQ16 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOCK3Q9BQ16 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPOCK3Q9BQ16 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPOCK3Q9BQ16 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOCK3Q9BQ16 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOCK3Q9BQ16 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOCK3Q9BQ16 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPOCK3Q9BQ16 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPOCK3Q9BQ16 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPOCK3Q9BQ16 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPOCK3Q9BQ16 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms