RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74.94■■■■■ 9.59
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PTF1A-201ENST00000376504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.74■■■■■ 7.63
PTF1A-201ENST00000376504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa62.04■■■■■ 7.52
PTF1A-201ENST00000376504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61.97■■■■■ 7.51
PTF1A-201ENST00000376504 MYO15BQ96JP2 1530 aa61.74■■■■■ 7.47
PTF1A-201ENST00000376504 NACADO15069 1562 aa61.66■■■■■ 7.46
PTF1A-201ENST00000376504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa61.37■■■■■ 7.42
PTF1A-201ENST00000376504 SCRIBQ14160 1630 aa60.38■■■■■ 7.26
PTF1A-201ENST00000376504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa60.2■■■■■ 7.23
PTF1A-201ENST00000376504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.13■■■■■ 7.22
PTF1A-201ENST00000376504 BICRAQ9NZM4 1560 aa59.59■■■■■ 7.13
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PTF1A-201ENST00000376504 SMARCA4P51532 1647 aa57.88■■■■■ 6.86
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PTF1A-201ENST00000376504 MROH2BQ7Z745 1585 aa57.83■■■■■ 6.85
PTF1A-201ENST00000376504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.65■■■■■ 6.82
PTF1A-201ENST00000376504 WIZO95785 1651 aa57.31■■■■■ 6.77
PTF1A-201ENST00000376504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.27■■■■■ 6.76
PTF1A-201ENST00000376504 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.27■■■■■ 6.76
PTF1A-201ENST00000376504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP57.25■■■■■ 6.76
PTF1A-201ENST00000376504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa57.16■■■■■ 6.74
PTF1A-201ENST00000376504 SMARCA2P51531 1590 aa57.12■■■■■ 6.74
PTF1A-201ENST00000376504 NCAPD3P42695 1498 aa56.88■■■■■ 6.7
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PTF1A-201ENST00000376504 CFTRP13569 1480 aa55.29■■■■■ 6.44
PTF1A-201ENST00000376504 CADPSQ9ULU8 1353 aa55.29■■■■■ 6.44
PTF1A-201ENST00000376504 NESP48681 1621 aa55.17■■■■■ 6.42
PTF1A-201ENST00000376504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa55.16■■■■■ 6.42
PTF1A-201ENST00000376504 PRDM2Q13029 1718 aa55.09■■■■■ 6.41
PTF1A-201ENST00000376504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.68■■■■■ 6.34
PTF1A-201ENST00000376504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54.68■■■■■ 6.34
PTF1A-201ENST00000376504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.59■■■■■ 6.33
PTF1A-201ENST00000376504 ABCC8Q09428 1581 aa54.5■■■■■ 6.32
PTF1A-201ENST00000376504 CEP164Q9UPV0 1460 aa54.46■■■■■ 6.31
PTF1A-201ENST00000376504 CHIC1Q5VXU3 224 aa54.31■■■■■ 6.28
PTF1A-201ENST00000376504 ERCC6Q03468 1493 aa54.29■■■■■ 6.28
PTF1A-201ENST00000376504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54.28■■■■■ 6.28
PTF1A-201ENST00000376504 CUX1P39880 1505 aa54.17■■■■■ 6.26
PTF1A-201ENST00000376504 SYNJ1O43426 1573 aa54.17■■■■■ 6.26
PTF1A-201ENST00000376504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP54.1■■■■■ 6.25
PTF1A-201ENST00000376504 MRC2Q9UBG0 1479 aa54.09■■■■■ 6.25
PTF1A-201ENST00000376504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa54.06■■■■■ 6.24
PTF1A-201ENST00000376504 TOP2BQ02880 1626 aa54.05■■■■■ 6.24
PTF1A-201ENST00000376504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54.05■■■■■ 6.24
PTF1A-201ENST00000376504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.02■■■■■ 6.24
PTF1A-201ENST00000376504 TOPBP1Q92547 1522 aa54■■■■■ 6.23
PTF1A-201ENST00000376504 TRIM41Q8WV44 630 aa53.95■■■■■ 6.23
PTF1A-201ENST00000376504 WDR62O43379 1518 aa53.89■■■■■ 6.22
PTF1A-201ENST00000376504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53.72■■■■■ 6.19
PTF1A-201ENST00000376504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP53.64■■■■■ 6.18
PTF1A-201ENST00000376504 CUX2O14529 1486 aa53.44■■■■■ 6.14
PTF1A-201ENST00000376504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53.41■■■■■ 6.14
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PTF1A-201ENST00000376504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP53.33■■■■■ 6.13
PTF1A-201ENST00000376504 WDR97A6NE52 1622 aa53.28■■■■■ 6.12
PTF1A-201ENST00000376504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.25■■■■■ 6.12
PTF1A-201ENST00000376504 IFT140Q96RY7 1462 aa53.24■■■■■ 6.11
PTF1A-201ENST00000376504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa53.1■■■■■ 6.09
PTF1A-201ENST00000376504 KIF27Q86VH2 1401 aa53■■■■■ 6.07
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.97■■■■■ 6.07
PTF1A-201ENST00000376504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52.96■■■■■ 6.07
PTF1A-201ENST00000376504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.95■■■■■ 6.07
PTF1A-201ENST00000376504 EEA1Q15075 1411 aa52.93■■■■■ 6.06
PTF1A-201ENST00000376504 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP52.87■■■■■ 6.05
PTF1A-201ENST00000376504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.83■■■■■ 6.05
PTF1A-201ENST00000376504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.83■■■■■ 6.05
PTF1A-201ENST00000376504 GAPVD1Q14C86 1478 aa52.82■■■■■ 6.05
PTF1A-201ENST00000376504 PBRM1Q86U86 1689 aa52.71■■■■■ 6.03
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PTF1A-201ENST00000376504 IGF1RP08069 1367 aa52.66■■■■■ 6.02
PTF1A-201ENST00000376504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.63■■■■■ 6.02
PTF1A-201ENST00000376504 GRIN2BQ13224 1484 aa52.59■■■■■ 6.01
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PTF1A-201ENST00000376504 KIF21BO75037 1637 aa52.36■■■■■ 5.97
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PTF1A-201ENST00000376504 ADAMTS12P58397 1594 aa52.34■■■■■ 5.97
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PTF1A-201ENST00000376504 SYNJ2O15056 1496 aa52.09■■■■■ 5.93
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PTF1A-201ENST00000376504 CHD1O14646 1710 aa51.93■■■■■ 5.9
PTF1A-201ENST00000376504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.91■■■■■ 5.9
PTF1A-201ENST00000376504 FBLN2P98095 1184 aa51.84■■■■■ 5.89
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PTF1A-201ENST00000376504 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51.73■■■■■ 5.87
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