RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 NISCHQ9Y2I1 1504 aa75.02■■■■■ 9.6
INO80B-201ENST00000233331 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa66.86■■■■■ 8.29
INO80B-201ENST00000233331 ABCC9O60706 1549 aa65.76■■■■■ 8.12
INO80B-201ENST00000233331 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa63.09■■■■■ 7.69
INO80B-201ENST00000233331 NACADO15069 1562 aa62.92■■■■■ 7.66
INO80B-201ENST00000233331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa62.85■■■■■ 7.65
INO80B-201ENST00000233331 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.45■■■■■ 7.59
INO80B-201ENST00000233331 MYO15BQ96JP2 1530 aa62.4■■■■■ 7.58
INO80B-201ENST00000233331 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa62.03■■■■■ 7.52
INO80B-201ENST00000233331 UNC13AQ9UPW8 1703 aa61.66■■■■■ 7.46
INO80B-201ENST00000233331 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP61.37■■■■■ 7.41
INO80B-201ENST00000233331 BICRAQ9NZM4 1560 aa61.18■■■■■ 7.38
INO80B-201ENST00000233331 SCRIBQ14160 1630 aa61.04■■■■■ 7.36
INO80B-201ENST00000233331 DNAJC5BQ9UF47 199 aa60.57■■■■■ 7.29
INO80B-201ENST00000233331 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.48■■■■■ 7.27
INO80B-201ENST00000233331 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP59.61■■■■■ 7.13
INO80B-201ENST00000233331 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.45■■■■■ 7.11
INO80B-201ENST00000233331 CECR2Q9BXF3 1484 aa59.1■■■■■ 7.05
INO80B-201ENST00000233331 SMARCA4P51532 1647 aa58.31■■■■■ 6.93
INO80B-201ENST00000233331 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP58.19■■■■■ 6.91
INO80B-201ENST00000233331 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa58.05■■■■■ 6.88
INO80B-201ENST00000233331 NCAPD3P42695 1498 aa58.03■■■■■ 6.88
INO80B-201ENST00000233331 SMARCA2P51531 1590 aa57.97■■■■■ 6.87
INO80B-201ENST00000233331 MROH2BQ7Z745 1585 aa57.83■■■■■ 6.85
INO80B-201ENST00000233331 HMGXB3Q12766 1538 aa57.76■■■■■ 6.84
INO80B-201ENST00000233331 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.7■■■■■ 6.83
INO80B-201ENST00000233331 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57.59■■■■■ 6.81
INO80B-201ENST00000233331 WIZO95785 1651 aa57.21■■■■■ 6.75
INO80B-201ENST00000233331 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.03■■■■■ 6.72
INO80B-201ENST00000233331 NESP48681 1621 aa56.8■■■■■ 6.68
INO80B-201ENST00000233331 ERCC6Q03468 1493 aa56.71■■■■■ 6.67
INO80B-201ENST00000233331 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa56.59■■■■■ 6.65
INO80B-201ENST00000233331 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56.58■■■■■ 6.65
INO80B-201ENST00000233331 CADPSQ9ULU8 1353 aa56.34■■■■■ 6.61
INO80B-201ENST00000233331 PDS5BQ9NTI5 1447 aa56.22■■■■■ 6.59
INO80B-201ENST00000233331 CUX2O14529 1486 aa56.19■■■■■ 6.59
INO80B-201ENST00000233331 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa56.13■■■■■ 6.58
INO80B-201ENST00000233331 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP56.02■■■■■ 6.56
INO80B-201ENST00000233331 CFTRP13569 1480 aa55.94■■■■■ 6.55
INO80B-201ENST00000233331 CCDC88BA6NC98 1476 aa55.89■■■■■ 6.54
INO80B-201ENST00000233331 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55.73■■■■■ 6.51
INO80B-201ENST00000233331 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.7■■■■■ 6.51
INO80B-201ENST00000233331 MRC2Q9UBG0 1479 aa55.69■■■■■ 6.5
INO80B-201ENST00000233331 PRDM2Q13029 1718 aa55.54■■■■■ 6.48
INO80B-201ENST00000233331 WDR62O43379 1518 aa55.51■■■■■ 6.48
INO80B-201ENST00000233331 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55.4■■■■■ 6.46
INO80B-201ENST00000233331 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP55.2■■■■■ 6.43
INO80B-201ENST00000233331 TOPBP1Q92547 1522 aa54.8■■■■■ 6.36
INO80B-201ENST00000233331 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.78■■■■■ 6.36
INO80B-201ENST00000233331 ABCC8Q09428 1581 aa54.74■■■■■ 6.35
INO80B-201ENST00000233331 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54.72■■■■■ 6.35
INO80B-201ENST00000233331 IFT140Q96RY7 1462 aa54.54■■■■■ 6.32
INO80B-201ENST00000233331 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP54.33■■■■■ 6.29
INO80B-201ENST00000233331 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP54.32■■■■■ 6.29
INO80B-201ENST00000233331 CUX1P39880 1505 aa54.29■■■■■ 6.28
INO80B-201ENST00000233331 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
INO80B-201ENST00000233331 FGD5Q6ZNL6 1462 aa54.16■■■■■ 6.26
INO80B-201ENST00000233331 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP54.12■■■■■ 6.26
INO80B-201ENST00000233331 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa54.1■■■■■ 6.25
INO80B-201ENST00000233331 SOGA1O94964 1423 aa54.08■■■■■ 6.25
INO80B-201ENST00000233331 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP53.97■■■■■ 6.231e-7■■■■□ 20.1
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INO80B-201ENST00000233331 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP53.81■■■■■ 6.2
INO80B-201ENST00000233331 OSCARQ8IYS5 282 aa53.77■■■■■ 6.2
INO80B-201ENST00000233331 WDR97A6NE52 1622 aa53.77■■■■■ 6.2
INO80B-201ENST00000233331 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53.73■■■■■ 6.19
INO80B-201ENST00000233331 TOP2BQ02880 1626 aa53.72■■■■■ 6.19
INO80B-201ENST00000233331 SYNJ1O43426 1573 aa53.72■■■■■ 6.19
INO80B-201ENST00000233331 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.59■■■■■ 6.17
INO80B-201ENST00000233331 CHD1O14646 1710 aa53.51■■■■■ 6.16
INO80B-201ENST00000233331 GRIN2BQ13224 1484 aa53.5■■■■■ 6.15
INO80B-201ENST00000233331 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53.5■■■■■ 6.15
INO80B-201ENST00000233331 GAPVD1Q14C86 1478 aa53.45■■■■■ 6.15
INO80B-201ENST00000233331 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.43■■■■■ 6.14
INO80B-201ENST00000233331 FBLN2P98095 1184 aa53.41■■■■■ 6.14
INO80B-201ENST00000233331 PBRM1Q86U86 1689 aa53.41■■■■■ 6.14
INO80B-201ENST00000233331 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53.39■■■■■ 6.14
INO80B-201ENST00000233331 SYNJ2O15056 1496 aa53.19■■■■■ 6.1
INO80B-201ENST00000233331 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP53.18■■■■■ 6.1
INO80B-201ENST00000233331 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53■■■■■ 6.08
INO80B-201ENST00000233331 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa53■■■■■ 6.08
INO80B-201ENST00000233331 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53■■■■■ 6.08
INO80B-201ENST00000233331 ADAMTS12P58397 1594 aa52.97■■■■■ 6.07
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF11O15085 1522 aa52.96■■■■■ 6.07
INO80B-201ENST00000233331 TRIM41Q8WV44 630 aa52.95■■■■■ 6.07
INO80B-201ENST00000233331 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.95■■■■■ 6.07
INO80B-201ENST00000233331 CLASP1Q7Z460 1538 aa52.89■■■■■ 6.06
INO80B-201ENST00000233331 FHAD1B1AJZ9 1412 aa52.83■■■■■ 6.05
INO80B-201ENST00000233331 GRIN2AQ12879 1464 aa52.82■■■■■ 6.05
INO80B-201ENST00000233331 KIF27Q86VH2 1401 aa52.71■■■■■ 6.03
INO80B-201ENST00000233331 CEP170Q5SW79 1584 aa52.58■■■■■ 6.01
INO80B-201ENST00000233331 NUP160Q12769 1436 aa52.57■■■■■ 6.01
INO80B-201ENST00000233331 ARAP1Q96P48 1450 aa52.51■■■■■ 6
INO80B-201ENST00000233331 IGF1RP08069 1367 aa52.49■■■■■ 5.99
INO80B-201ENST00000233331 CYB5RLQ6IPT4 315 aa52.46■■■■■ 5.99
INO80B-201ENST00000233331 CUL7Q14999 1698 aa52.43■■■■■ 5.98
INO80B-201ENST00000233331 SHROOM2Q13796 1616 aa52.22■■■■■ 5.95
INO80B-201ENST00000233331 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52.21■■■■■ 5.95
INO80B-201ENST00000233331 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa52.19■■■■■ 5.94
INO80B-201ENST00000233331 ERCC6L2Q5T890 1561 aa52.16■■■■■ 5.94
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