RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617066.4

PRR5-217, Transcript of proline rich 5, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRR5, Length 1,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-217ENST00000617066 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74,82■■■■■ 9,57
PRR5-217ENST00000617066 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa65,45■■■■■ 8,07
PRR5-217ENST00000617066 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62,78■■■■■ 7,64
PRR5-217ENST00000617066 ABCC9O60706 1549 aa62,2■■■■■ 7,55
PRR5-217ENST00000617066 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa61,9■■■■■ 7,5
PRR5-217ENST00000617066 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61,79■■■■■ 7,48
PRR5-217ENST00000617066 MYO15BQ96JP2 1530 aa61,33■■■■■ 7,41
PRR5-217ENST00000617066 NACADO15069 1562 aa61,05■■■■■ 7,36
PRR5-217ENST00000617066 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60,65■■■■■ 7,3
PRR5-217ENST00000617066 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60,6■■■■■ 7,29
PRR5-217ENST00000617066 SCRIBQ14160 1630 aa60,08■■■■■ 7,21
PRR5-217ENST00000617066 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59,4■■■■■ 7,1
PRR5-217ENST00000617066 BICRAQ9NZM4 1560 aa58,82■■■■■ 7,01
PRR5-217ENST00000617066 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58,56■■■■■ 6,97
PRR5-217ENST00000617066 CECR2Q9BXF3 1484 aa58,16■■■■■ 6,9
PRR5-217ENST00000617066 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP58,13■■■■■ 6,9
PRR5-217ENST00000617066 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57,88■■■■■ 6,86
PRR5-217ENST00000617066 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP57,79■■■■■ 6,84
PRR5-217ENST00000617066 MROH2BQ7Z745 1585 aa57,78■■■■■ 6,84
PRR5-217ENST00000617066 SMARCA4P51532 1647 aa57,6■■■■■ 6,81
PRR5-217ENST00000617066 WIZO95785 1651 aa57,27■■■■■ 6,76
PRR5-217ENST00000617066 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57,06■■■■■ 6,72
PRR5-217ENST00000617066 PEG3Q9GZU2 1588 aa56,95■■■■■ 6,71
PRR5-217ENST00000617066 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56,77■■■■■ 6,68
PRR5-217ENST00000617066 SMARCA2P51531 1590 aa56,71■■■■■ 6,67
PRR5-217ENST00000617066 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56,69■■■■■ 6,66
PRR5-217ENST00000617066 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP56,39■■■■■ 6,62
PRR5-217ENST00000617066 NCAPD3P42695 1498 aa56,35■■■■■ 6,61
PRR5-217ENST00000617066 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56,31■■■■■ 6,61
PRR5-217ENST00000617066 HMGXB3Q12766 1538 aa56,24■■■■■ 6,59
PRR5-217ENST00000617066 CCDC88BA6NC98 1476 aa56,1■■■■■ 6,57
PRR5-217ENST00000617066 CHIC1Q5VXU3 224 aa55,49■■■■■ 6,47
PRR5-217ENST00000617066 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55,26■■■■■ 6,44
PRR5-217ENST00000617066 CFTRP13569 1480 aa54,98■■■■■ 6,39
PRR5-217ENST00000617066 CADPSQ9ULU8 1353 aa54,86■■■■■ 6,37
PRR5-217ENST00000617066 ABCC8Q09428 1581 aa54,75■■■■■ 6,36
PRR5-217ENST00000617066 TRIM41Q8WV44 630 aa54,71■■■■■ 6,35
PRR5-217ENST00000617066 PRDM2Q13029 1718 aa54,68■■■■■ 6,34
PRR5-217ENST00000617066 NESP48681 1621 aa54,5■■■■■ 6,32
PRR5-217ENST00000617066 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54,49■■■■■ 6,31
PRR5-217ENST00000617066 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54,47■■■■■ 6,315e-6■■■■■ 46
PRR5-217ENST00000617066 SYNJ1O43426 1573 aa54,28■■■■■ 6,28
PRR5-217ENST00000617066 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54,24■■■■■ 6,27
PRR5-217ENST00000617066 TOP2BQ02880 1626 aa54,1■■■■■ 6,25
PRR5-217ENST00000617066 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa54,06■■■■■ 6,24
PRR5-217ENST00000617066 CUX1P39880 1505 aa54,06■■■■■ 6,24
PRR5-217ENST00000617066 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54,06■■■■■ 6,24
PRR5-217ENST00000617066 CEP164Q9UPV0 1460 aa53,94■■■■■ 6,22
PRR5-217ENST00000617066 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53,85■■■■■ 6,21
PRR5-217ENST00000617066 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53,7■■■■■ 6,19
PRR5-217ENST00000617066 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP53,66■■■■■ 6,18
PRR5-217ENST00000617066 SOGA1O94964 1423 aa53,65■■■■■ 6,18
PRR5-217ENST00000617066 TOPBP1Q92547 1522 aa53,63■■■■■ 6,18
PRR5-217ENST00000617066 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53,61■■■■■ 6,17
PRR5-217ENST00000617066 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53,52■■■■■ 6,16
PRR5-217ENST00000617066 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa53,48■■■■■ 6,15
PRR5-217ENST00000617066 EEA1Q15075 1411 aa53,47■■■■■ 6,15
PRR5-217ENST00000617066 MRC2Q9UBG0 1479 aa53,41■■■■■ 6,14
PRR5-217ENST00000617066 ERCC6Q03468 1493 aa53,35■■■■■ 6,13
PRR5-217ENST00000617066 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP53,33■■■■■ 6,13
PRR5-217ENST00000617066 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa53,32■■■■■ 6,13
PRR5-217ENST00000617066 CSRNP3Q8WYN3 585 aa53,2■■■■■ 6,11
PRR5-217ENST00000617066 WDR62O43379 1518 aa53,16■■■■■ 6,1
PRR5-217ENST00000617066 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53,14■■■■■ 6,1
PRR5-217ENST00000617066 KIF27Q86VH2 1401 aa53,12■■■■■ 6,09
PRR5-217ENST00000617066 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53,1■■■■■ 6,09
PRR5-217ENST00000617066 CUX2O14529 1486 aa53,07■■■■■ 6,09
PRR5-217ENST00000617066 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53,06■■■■■ 6,08
PRR5-217ENST00000617066 WDR97A6NE52 1622 aa52,94■■■■■ 6,06
PRR5-217ENST00000617066 EHMT2Q96KQ7 1210 aa52,88■■■■■ 6,06
PRR5-217ENST00000617066 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52,88■■■■■ 6,06
PRR5-217ENST00000617066 KIF21BO75037 1637 aa52,82■■■■■ 6,05
PRR5-217ENST00000617066 IGF1RP08069 1367 aa52,73■■■■■ 6,03
PRR5-217ENST00000617066 GOLGA3Q08378 1498 aa52,7■■■■■ 6,03
PRR5-217ENST00000617066 PRXQ9BXM0 1461 aa52,7■■■■■ 6,03
PRR5-217ENST00000617066 IFT140Q96RY7 1462 aa52,69■■■■■ 6,03
PRR5-217ENST00000617066 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52,66■■■■■ 6,02
PRR5-217ENST00000617066 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52,64■■■■■ 6,02
PRR5-217ENST00000617066 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa52,58■■■■■ 6,01
PRR5-217ENST00000617066 GAPVD1Q14C86 1478 aa52,55■■■■■ 6
PRR5-217ENST00000617066 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52,54■■■■■ 6
PRR5-217ENST00000617066 TNIKQ9UKE5 1360 aa52,47■■■■■ 5,99
PRR5-217ENST00000617066 UBTFP17480 764 aaKnown RBP52,43■■■■■ 5,98
PRR5-217ENST00000617066 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52,43■■■■■ 5,98
PRR5-217ENST00000617066 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52,42■■■■■ 5,98
PRR5-217ENST00000617066 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52,39■■■■■ 5,981e-6■■■■□ 21,9
PRR5-217ENST00000617066 CUL7Q14999 1698 aa52,35■■■■■ 5,97
PRR5-217ENST00000617066 PBRM1Q86U86 1689 aa52,3■■■■■ 5,96
PRR5-217ENST00000617066 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52,22■■■■■ 5,95
PRR5-217ENST00000617066 GRIN2BQ13224 1484 aa52,21■■■■■ 5,95
PRR5-217ENST00000617066 CEP162Q5TB80 1403 aa52,15■■■■■ 5,94
PRR5-217ENST00000617066 ADAMTS12P58397 1594 aa52■■■■■ 5,92
PRR5-217ENST00000617066 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51,99■■■■■ 5,91
PRR5-217ENST00000617066 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51,91■■■■■ 5,9
PRR5-217ENST00000617066 CLIP1P30622 1438 aa51,84■■■■■ 5,89
PRR5-217ENST00000617066 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51,82■■■■■ 5,89
PRR5-217ENST00000617066 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51,7■■■■■ 5,87
PRR5-217ENST00000617066 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP51,67■■■■■ 5,86
PRR5-217ENST00000617066 SYNJ2O15056 1496 aa51,62■■■■■ 5,85
PRR5-217ENST00000617066 GRIN2AQ12879 1464 aa51,57■■■■■ 5,85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11,4 ms