RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 NISCHQ9Y2I1 1504 aa75,29■■■■■ 9,64
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa67,11■■■■■ 8,33
CMTM4-204ENST00000563952 ABCC9O60706 1549 aa66,14■■■■■ 8,18
CMTM4-204ENST00000563952 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa63,39■■■■■ 7,74
CMTM4-204ENST00000563952 DCAF8L2P0C7V8 631 aa63,21■■■■■ 7,71
CMTM4-204ENST00000563952 NACADO15069 1562 aa63,18■■■■■ 7,71
CMTM4-204ENST00000563952 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62,62■■■■■ 7,61
CMTM4-204ENST00000563952 MYO15BQ96JP2 1530 aa62,6■■■■■ 7,61
CMTM4-204ENST00000563952 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa62,2■■■■■ 7,55
CMTM4-204ENST00000563952 UNC13AQ9UPW8 1703 aa61,99■■■■■ 7,51
CMTM4-204ENST00000563952 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP61,76■■■■■ 7,48
CMTM4-204ENST00000563952 BICRAQ9NZM4 1560 aa61,48■■■■■ 7,43
CMTM4-204ENST00000563952 SCRIBQ14160 1630 aa61,3■■■■■ 7,4
CMTM4-204ENST00000563952 DNAJC5BQ9UF47 199 aa61,05■■■■■ 7,36
CMTM4-204ENST00000563952 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60,71■■■■■ 7,31
CMTM4-204ENST00000563952 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP59,9■■■■■ 7,18
CMTM4-204ENST00000563952 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59,79■■■■■ 7,16
CMTM4-204ENST00000563952 CECR2Q9BXF3 1484 aa59,45■■■■■ 7,11
CMTM4-204ENST00000563952 SMARCA4P51532 1647 aa58,53■■■■■ 6,96
CMTM4-204ENST00000563952 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP58,38■■■■■ 6,94
CMTM4-204ENST00000563952 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa58,3■■■■■ 6,92
CMTM4-204ENST00000563952 NCAPD3P42695 1498 aa58,29■■■■■ 6,92
CMTM4-204ENST00000563952 SMARCA2P51531 1590 aa58,2■■■■■ 6,91
CMTM4-204ENST00000563952 MROH2BQ7Z745 1585 aa58,05■■■■■ 6,88
CMTM4-204ENST00000563952 HMGXB3Q12766 1538 aa57,98■■■■■ 6,87
CMTM4-204ENST00000563952 PEG3Q9GZU2 1588 aa57,9■■■■■ 6,86
CMTM4-204ENST00000563952 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57,83■■■■■ 6,85
CMTM4-204ENST00000563952 WIZO95785 1651 aa57,44■■■■■ 6,79
CMTM4-204ENST00000563952 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57,21■■■■■ 6,75
CMTM4-204ENST00000563952 NESP48681 1621 aa57,11■■■■■ 6,73
CMTM4-204ENST00000563952 ERCC6Q03468 1493 aa57,05■■■■■ 6,72
CMTM4-204ENST00000563952 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa56,84■■■■■ 6,69
CMTM4-204ENST00000563952 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56,76■■■■■ 6,68
CMTM4-204ENST00000563952 CADPSQ9ULU8 1353 aa56,6■■■■■ 6,65
CMTM4-204ENST00000563952 CUX2O14529 1486 aa56,51■■■■■ 6,64
CMTM4-204ENST00000563952 PDS5BQ9NTI5 1447 aa56,48■■■■■ 6,63
CMTM4-204ENST00000563952 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa56,43■■■■■ 6,62
CMTM4-204ENST00000563952 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP56,3■■■■■ 6,6
CMTM4-204ENST00000563952 CFTRP13569 1480 aa56,17■■■■■ 6,58
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC88BA6NC98 1476 aa56,1■■■■■ 6,57
CMTM4-204ENST00000563952 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55,99■■■■■ 6,55
CMTM4-204ENST00000563952 MRC2Q9UBG0 1479 aa55,95■■■■■ 6,55
CMTM4-204ENST00000563952 CEP164Q9UPV0 1460 aa55,95■■■■■ 6,55
CMTM4-204ENST00000563952 WDR62O43379 1518 aa55,77■■■■■ 6,52
CMTM4-204ENST00000563952 PRDM2Q13029 1718 aa55,76■■■■■ 6,52
CMTM4-204ENST00000563952 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa55,71■■■■■ 6,51
CMTM4-204ENST00000563952 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55,57■■■■■ 6,49
CMTM4-204ENST00000563952 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP55,46■■■■■ 6,47
CMTM4-204ENST00000563952 TOPBP1Q92547 1522 aa55,05■■■■■ 6,4
CMTM4-204ENST00000563952 ABCC8Q09428 1581 aa54,97■■■■■ 6,39
CMTM4-204ENST00000563952 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54,93■■■■■ 6,38
CMTM4-204ENST00000563952 IFT140Q96RY7 1462 aa54,78■■■■■ 6,36
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP54,6■■■■■ 6,33
CMTM4-204ENST00000563952 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP54,54■■■■■ 6,32
CMTM4-204ENST00000563952 CUX1P39880 1505 aa54,49■■■■■ 6,31
CMTM4-204ENST00000563952 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP54,46■■■■■ 6,31
CMTM4-204ENST00000563952 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP54,38■■■■■ 6,3
CMTM4-204ENST00000563952 FGD5Q6ZNL6 1462 aa54,37■■■■■ 6,29
CMTM4-204ENST00000563952 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa54,35■■■■■ 6,29
CMTM4-204ENST00000563952 SOGA1O94964 1423 aa54,32■■■■■ 6,29
CMTM4-204ENST00000563952 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP54,25■■■■■ 6,28
CMTM4-204ENST00000563952 OSCARQ8IYS5 282 aa54,13■■■■■ 6,26
CMTM4-204ENST00000563952 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP54,09■■■■■ 6,25
CMTM4-204ENST00000563952 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP53,97■■■■■ 6,23
CMTM4-204ENST00000563952 WDR97A6NE52 1622 aa53,95■■■■■ 6,23
CMTM4-204ENST00000563952 TOP2BQ02880 1626 aa53,9■■■■■ 6,22
CMTM4-204ENST00000563952 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53,9■■■■■ 6,22
CMTM4-204ENST00000563952 SYNJ1O43426 1573 aa53,89■■■■■ 6,22
CMTM4-204ENST00000563952 CHD1O14646 1710 aa53,8■■■■■ 6,2
CMTM4-204ENST00000563952 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53,78■■■■■ 6,2
CMTM4-204ENST00000563952 FBLN2P98095 1184 aa53,75■■■■■ 6,2
CMTM4-204ENST00000563952 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53,74■■■■■ 6,19
CMTM4-204ENST00000563952 GRIN2BQ13224 1484 aa53,72■■■■■ 6,19
CMTM4-204ENST00000563952 GAPVD1Q14C86 1478 aa53,69■■■■■ 6,19
CMTM4-204ENST00000563952 PBRM1Q86U86 1689 aa53,63■■■■■ 6,18
CMTM4-204ENST00000563952 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53,63■■■■■ 6,18
CMTM4-204ENST00000563952 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53,61■■■■■ 6,17
CMTM4-204ENST00000563952 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP53,48■■■■■ 6,15
CMTM4-204ENST00000563952 SYNJ2O15056 1496 aa53,42■■■■■ 6,14
CMTM4-204ENST00000563952 TRIM41Q8WV44 630 aa53,4■■■■■ 6,14
CMTM4-204ENST00000563952 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53,35■■■■■ 6,13
CMTM4-204ENST00000563952 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa53,35■■■■■ 6,13
CMTM4-204ENST00000563952 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53,35■■■■■ 6,13
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGEF11O15085 1522 aa53,27■■■■■ 6,12
CMTM4-204ENST00000563952 ADAMTS12P58397 1594 aa53,16■■■■■ 6,1
CMTM4-204ENST00000563952 CLASP1Q7Z460 1538 aa53,14■■■■■ 6,1
CMTM4-204ENST00000563952 ERICH3Q5RHP9 1530 aa53,13■■■■■ 6,1
CMTM4-204ENST00000563952 GRIN2AQ12879 1464 aa53,03■■■■■ 6,08
CMTM4-204ENST00000563952 FHAD1B1AJZ9 1412 aa53,03■■■■■ 6,08
CMTM4-204ENST00000563952 KIF27Q86VH2 1401 aa52,88■■■■■ 6,06
CMTM4-204ENST00000563952 CYB5RLQ6IPT4 315 aa52,83■■■■■ 6,05
CMTM4-204ENST00000563952 CEP170Q5SW79 1584 aa52,81■■■■■ 6,05
CMTM4-204ENST00000563952 ARAP1Q96P48 1450 aa52,81■■■■■ 6,04
CMTM4-204ENST00000563952 NUP160Q12769 1436 aa52,79■■■■■ 6,04
CMTM4-204ENST00000563952 IGF1RP08069 1367 aa52,7■■■■■ 6,03
CMTM4-204ENST00000563952 CUL7Q14999 1698 aa52,6■■■■■ 6,01
CMTM4-204ENST00000563952 SHROOM2Q13796 1616 aa52,45■■■■■ 5,99
CMTM4-204ENST00000563952 ERCC6L2Q5T890 1561 aa52,43■■■■■ 5,98
CMTM4-204ENST00000563952 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52,39■■■■■ 5,98
CMTM4-204ENST00000563952 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa52,39■■■■■ 5,98
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