RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		77.34	■■■■■ 9.97
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OLFM1-208	ENST00000392991	ABCC9	O60706	1549 aa		67.15	■■■■■ 8.34
OLFM1-208	ENST00000392991	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		64.61	■■■■■ 7.93
OLFM1-208	ENST00000392991	NACAD	O15069	1562 aa		64.56	■■■■■ 7.93
OLFM1-208	ENST00000392991	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	64.48	■■■■■ 7.91
OLFM1-208	ENST00000392991	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		64.46	■■■■■ 7.91
OLFM1-208	ENST00000392991	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		64.22	■■■■■ 7.87
OLFM1-208	ENST00000392991	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		63.99	■■■■■ 7.83
OLFM1-208	ENST00000392991	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		63.2	■■■■■ 7.71
OLFM1-208	ENST00000392991	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	62.74	■■■■■ 7.63
OLFM1-208	ENST00000392991	SCRIB	Q14160	1630 aa		62.73	■■■■■ 7.63
OLFM1-208	ENST00000392991	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		62.73	■■■■■ 7.63
OLFM1-208	ENST00000392991	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		62	■■■■■ 7.52
OLFM1-208	ENST00000392991	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		61.57	■■■■■ 7.45
OLFM1-208	ENST00000392991	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	61.02	■■■■■ 7.36
OLFM1-208	ENST00000392991	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		60.75	■■■■■ 7.32
OLFM1-208	ENST00000392991	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		60.31	■■■■■ 7.25
OLFM1-208	ENST00000392991	SMARCA4	P51532	1647 aa		60.01	■■■■■ 7.2
OLFM1-208	ENST00000392991	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	59.92	■■■■■ 7.18
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OLFM1-208	ENST00000392991	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		59.64	■■■■■ 7.14
OLFM1-208	ENST00000392991	NCAPD3	P42695	1498 aa		59.58	■■■■■ 7.13
OLFM1-208	ENST00000392991	SMARCA2	P51531	1590 aa		59.54	■■■■■ 7.12
OLFM1-208	ENST00000392991	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		59.42	■■■■■ 7.1
OLFM1-208	ENST00000392991	HMGXB3	Q12766	1538 aa		59.31	■■■■■ 7.09
OLFM1-208	ENST00000392991	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	59.13	■■■■■ 7.06
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OLFM1-208	ENST00000392991	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	58.96	■■■■■ 7.03
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OLFM1-208	ENST00000392991	NES	P48681	1621 aa		58.16	■■■■■ 6.9
OLFM1-208	ENST00000392991	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		57.99	■■■■■ 6.87
OLFM1-208	ENST00000392991	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		57.83	■■■■■ 6.85
OLFM1-208	ENST00000392991	ERCC6	Q03468	1493 aa		57.82	■■■■■ 6.85
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		57.67	■■■■■ 6.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		57.56	■■■■■ 6.8
OLFM1-208	ENST00000392991	CFTR	P13569	1480 aa		57.53	■■■■■ 6.8
OLFM1-208	ENST00000392991	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		57.47	■■■■■ 6.79
OLFM1-208	ENST00000392991	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	57.47	■■■■■ 6.79
OLFM1-208	ENST00000392991	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	57.28	■■■■■ 6.76
OLFM1-208	ENST00000392991	CUX2	O14529	1486 aa		57.2	■■■■■ 6.75
OLFM1-208	ENST00000392991	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		57.19	■■■■■ 6.75
OLFM1-208	ENST00000392991	PRDM2	Q13029	1718 aa		57.11	■■■■■ 6.73
OLFM1-208	ENST00000392991	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		57.1	■■■■■ 6.73
OLFM1-208	ENST00000392991	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		57.01	■■■■■ 6.72
OLFM1-208	ENST00000392991	WDR62	O43379	1518 aa		56.84	■■■■■ 6.69
OLFM1-208	ENST00000392991	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	56.65	■■■■■ 6.66
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OLFM1-208	ENST00000392991	CUX1	P39880	1505 aa		55.94	■■■■■ 6.55
OLFM1-208	ENST00000392991	IFT140	Q96RY7	1462 aa		55.9	■■■■■ 6.54
OLFM1-208	ENST00000392991	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	55.84	■■■■■ 6.53
OLFM1-208	ENST00000392991	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		55.71	■■■■■ 6.51
OLFM1-208	ENST00000392991	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	55.71	■■■■■ 6.51
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	55.69	■■■■■ 6.51
OLFM1-208	ENST00000392991	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		55.6	■■■■■ 6.49
OLFM1-208	ENST00000392991	SOGA1	O94964	1423 aa		55.56	■■■■■ 6.49
OLFM1-208	ENST00000392991	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	55.56	■■■■■ 6.49
OLFM1-208	ENST00000392991	SYNJ1	O43426	1573 aa		55.49	■■■■■ 6.47
OLFM1-208	ENST00000392991	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	55.48	■■■■■ 6.47
OLFM1-208	ENST00000392991	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		55.47	■■■■■ 6.47
OLFM1-208	ENST00000392991	TOP2B	Q02880	1626 aa		55.46	■■■■■ 6.47
OLFM1-208	ENST00000392991	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	55.36	■■■■■ 6.45
OLFM1-208	ENST00000392991	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		55.31	■■■■■ 6.44
OLFM1-208	ENST00000392991	WDR97	A6NE52	1622 aa		55.28	■■■■■ 6.44
OLFM1-208	ENST00000392991	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	55.26	■■■■■ 6.44
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OLFM1-208	ENST00000392991	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		54.98	■■■■■ 6.39
OLFM1-208	ENST00000392991	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		54.93	■■■■■ 6.38
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OLFM1-208	ENST00000392991	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		54.86	■■■■■ 6.37
OLFM1-208	ENST00000392991	PBRM1	Q86U86	1689 aa		54.84	■■■■■ 6.37
OLFM1-208	ENST00000392991	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		54.78	■■■■■ 6.36
OLFM1-208	ENST00000392991	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	54.76	■■■■■ 6.36
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OLFM1-208	ENST00000392991	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	54.45	■■■■■ 6.31
OLFM1-208	ENST00000392991	ADAMTS12	P58397	1594 aa		54.45	■■■■■ 6.31
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OLFM1-208	ENST00000392991	TRIM41	Q8WV44	630 aa		54.25	■■■■■ 6.28
OLFM1-208	ENST00000392991	GRIN2A	Q12879	1464 aa		54.23	■■■■■ 6.27
OLFM1-208	ENST00000392991	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		54.18	■■■■■ 6.26
OLFM1-208	ENST00000392991	IGF1R	P08069	1367 aa		54.17	■■■■■ 6.26
OLFM1-208	ENST00000392991	CUL7	Q14999	1698 aa		54.02	■■■■■ 6.24
OLFM1-208	ENST00000392991	NUP160	Q12769	1436 aa		54.01	■■■■■ 6.24
OLFM1-208	ENST00000392991	ARHGEF11	O15085	1522 aa		53.99	■■■■■ 6.23
OLFM1-208	ENST00000392991	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		53.99	■■■■■ 6.23
OLFM1-208	ENST00000392991	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		53.99	■■■■■ 6.23
OLFM1-208	ENST00000392991	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		53.99	■■■■■ 6.23
OLFM1-208	ENST00000392991	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		53.99	■■■■■ 6.23
OLFM1-208	ENST00000392991	CEP170	Q5SW79	1584 aa		53.99	■■■■■ 6.23
OLFM1-208	ENST00000392991	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		53.83	■■■■■ 6.21
OLFM1-208	ENST00000392991	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		53.72	■■■■■ 6.19
OLFM1-208	ENST00000392991	SHROOM2	Q13796	1616 aa		53.59	■■■■■ 6.17
OLFM1-208	ENST00000392991	ARAP1	Q96P48	1450 aa		53.58	■■■■■ 6.17
OLFM1-208	ENST00000392991	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		53.53	■■■■■ 6.16

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