Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPN13Q12923 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPN13Q12923 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPN13Q12923 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN13Q12923 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN13Q12923 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN13Q12923 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN13Q12923 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN13Q12923 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN13Q12923 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN13Q12923 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN13Q12923 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN13Q12923 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN13Q12923 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN13Q12923 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN13Q12923 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN13Q12923 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN13Q12923 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN13Q12923 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN13Q12923 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN13Q12923 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN13Q12923 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN13Q12923 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN13Q12923 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN13Q12923 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN13Q12923 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN13Q12923 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN13Q12923 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN13Q12923 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN13Q12923 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN13Q12923 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN13Q12923 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN13Q12923 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPN13Q12923 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN13Q12923 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN13Q12923 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN13Q12923 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN13Q12923 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN13Q12923 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN13Q12923 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN13Q12923 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN13Q12923 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN13Q12923 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN13Q12923 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN13Q12923 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN13Q12923 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN13Q12923 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPN13Q12923 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN13Q12923 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN13Q12923 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN13Q12923 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN13Q12923 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN13Q12923 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN13Q12923 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN13Q12923 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN13Q12923 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN13Q12923 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN13Q12923 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN13Q12923 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN13Q12923 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN13Q12923 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN13Q12923 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN13Q12923 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN13Q12923 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN13Q12923 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN13Q12923 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN13Q12923 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN13Q12923 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN13Q12923 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN13Q12923 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN13Q12923 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPN13Q12923 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN13Q12923 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN13Q12923 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN13Q12923 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN13Q12923 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN13Q12923 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN13Q12923 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN13Q12923 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN13Q12923 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN13Q12923 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN13Q12923 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN13Q12923 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN13Q12923 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN13Q12923 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN13Q12923 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN13Q12923 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN13Q12923 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN13Q12923 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN13Q12923 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN13Q12923 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN13Q12923 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN13Q12923 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN13Q12923 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN13Q12923 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN13Q12923 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN13Q12923 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN13Q12923 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN13Q12923 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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