Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 29
PCBP2Q15366 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-21■■■■■ 29
PCBP2Q15366 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-21■■■■■ 29
PCBP2Q15366 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.311e-21■■■■■ 29
PCBP2Q15366 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 29
PCBP2Q15366 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 29
PCBP2Q15366 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 29
PCBP2Q15366 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 29
PCBP2Q15366 MAGI2-236ENST00000637441 5822 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 29
PCBP2Q15366 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 318.56■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 29
PCBP2Q15366 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 317.17■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 29
PCBP2Q15366 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 417.11■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 29
PCBP2Q15366 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 29
PCBP2Q15366 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 29
PCBP2Q15366 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.224e-10■■■■■ 29
PCBP2Q15366 HHEX-204ENST00000551454 1307 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.664e-10■■■■■ 29
PCBP2Q15366 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 29
PCBP2Q15366 ABHD14A-ACY1-225ENST00000637563 2622 ntTSL 518.21■□□□□ 0.514e-22■■■■■ 29
PCBP2Q15366 ABHD14A-ACY1-229ENST00000637978 1758 ntAPPRIS P5 TSL 516.22■□□□□ 0.194e-22■■■■■ 29
PCBP2Q15366 ACY1-219ENST00000637102 1488 ntTSL 313.19□□□□□ -0.34e-22■■■■■ 29
PCBP2Q15366 ABHD14A-ACY1-216ENST00000636660 1126 ntTSL 512.63□□□□□ -0.394e-22■■■■■ 29
PCBP2Q15366 ABHD14A-ACY1-205ENST00000635785 1060 ntTSL 511.41□□□□□ -0.584e-22■■■■■ 29
PCBP2Q15366 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.136e-10■■■■■ 29
PCBP2Q15366 SEMA4B-208ENST00000559074 1697 ntTSL 215.31■□□□□ 0.046e-10■■■■■ 29
PCBP2Q15366 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.26e-10■■■■■ 29
PCBP2Q15366 SEMA4B-204ENST00000558065 3751 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.836e-10■■■■■ 29
PCBP2Q15366 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 29
PCBP2Q15366 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 29
PCBP2Q15366 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 HNRNPA1-214ENST00000551803 372 ntTSL 35.67□□□□□ -1.51e-323■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 219.69■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 318.49■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 RBFOX2-204ENST00000397305 759 ntTSL 59.91□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 38.64□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 GBE1-203ENST00000484687 863 ntTSL 28.17□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 RBFOX2-213ENST00000491982 1004 ntTSL 27.99□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 WDFY3-204ENST00000502713 425 ntTSL 323.15■■□□□ 1.31e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CAPRIN1-203ENST00000526477 587 ntTSL 222.34■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CAPRIN1-205ENST00000528856 595 ntTSL 522.34■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.921e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SEC61A2-213ENST00000475268 2183 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.471e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 WDFY3-208ENST00000509172 453 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CAPRIN1-217ENST00000534825 668 ntTSL 316.81■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 COL11A2-205ENST00000457788 2099 ntTSL 516.01■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-22■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SEC61A2-214ENST00000495368 2311 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CAPRIN1-216ENST00000534042 574 ntTSL 515.45■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 HSPBAP1-201ENST00000306103 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 HSPBAP1-203ENST00000465044 2986 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.725e-30■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 AC012651.1-202ENST00000549793 3223 ntAPPRIS P1 TSL 210.37□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 APOBEC3C-202ENST00000428892 1056 ntTSL 310.19□□□□□ -0.785e-30■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.815e-30■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 AC012651.1-204ENST00000495723 3881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 AC012651.1-201ENST00000483208 3182 ntAPPRIS P1 TSL 29.85□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SEC61A2-204ENST00000379020 2252 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CLDN2-201ENST00000336803 2959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.951e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CLDN2-202ENST00000540876 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.961e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SPTLC3-204ENST00000450297 645 ntTSL 38.87□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 AC012651.1-203ENST00000466369 3501 ntAPPRIS P1 TSL 28.82□□□□□ -13e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.193e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 WDFY3-203ENST00000426414 3428 ntTSL 27.1□□□□□ -1.271e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SPTLC3-203ENST00000434210 572 ntTSL 37.06□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 TSC22D1-204ENST00000460842 903 ntTSL 36.99□□□□□ -1.293e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 TSC22D1-206ENST00000486464 1093 ntTSL 56.89□□□□□ -1.313e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.28□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.461e-15■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 KIF20B-204ENST00000478929 4900 ntTSL 1 (best)1.24□□□□□ -2.213e-8■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 39.77□□□□□ -0.856e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.43e-7■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 EIF2AK1-209ENST00000490523 905 ntTSL 28.67□□□□□ -1.023e-32■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 EGLN2-208ENST00000593972 935 ntTSL 223.37■■□□□ 1.333e-6■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 EGLN2-215ENST00000598654 590 ntTSL 321.14■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 RAB4B-EGLN2-203ENST00000601949 482 ntTSL 417.27■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 RAB4B-EGLN2-202ENST00000596216 624 ntTSL 312.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 28.9
PCBP2Q15366 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 28.9
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