RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.36■□□□□ 0.85
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APOBEC3C-201ENST00000361441 MYT1Q01538 1121 aa18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3C-201ENST00000361441 HRCP23327 699 aa18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3C-201ENST00000361441 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3C-201ENST00000361441 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC24A1O60721 1099 aa17.57■□□□□ 0.4
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
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APOBEC3C-201ENST00000361441 BCL11AQ9H165 835 aa17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.27■□□□□ 0.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
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APOBEC3C-201ENST00000361441 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.98■□□□□ 0.31
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APOBEC3C-201ENST00000361441 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.63■□□□□ 0.25
APOBEC3C-201ENST00000361441 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.59■□□□□ 0.25
APOBEC3C-201ENST00000361441 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM41Q8WV44 630 aa16.45■□□□□ 0.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCRIBQ14160 1630 aa16.39■□□□□ 0.21
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APOBEC3C-201ENST00000361441 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.18■□□□□ 0.18
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APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC136Q96JN2 1154 aa16■□□□□ 0.15
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APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.98■□□□□ 0.15
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APOBEC3C-201ENST00000361441 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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APOBEC3C-201ENST00000361441 PLEKHG5O94827 1062 aa15.87■□□□□ 0.13
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APOBEC3C-201ENST00000361441 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 SOGA1O94964 1423 aa15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 MSH5O43196 834 aa15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 NACADO15069 1562 aa15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.66■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP162Q5TB80 1403 aa15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 BCANQ96GW7 911 aa15.65■□□□□ 0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMARCA2P51531 1590 aa15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL27Q8NEV9 243 aa15.48■□□□□ 0.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMARCA4P51532 1647 aa15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITGAEP38570 1179 aa15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 FKBP8Q14318 412 aa15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLGA3Q08378 1498 aa15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 NBR1Q14596 966 aa15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLIP1P30622 1438 aa15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYNJ1O43426 1573 aa15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 EEA1Q15075 1411 aa15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARXQ96QS3 562 aa15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.21■□□□□ 0.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZMYND15Q9H091 742 aa15.17■□□□□ 0.02
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