Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FANCFQ9NPI8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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