RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215375.6

ATP5D-201, Transcript of ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP5D, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5D-201ENST00000215375 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.09■■■■■ 5.29
ATP5D-201ENST00000215375 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.93■■■■■ 4.46
ATP5D-201ENST00000215375 ABCC9O60706 1549 aa42.04■■■■■ 4.32
ATP5D-201ENST00000215375 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.41■■■■■ 4.06
ATP5D-201ENST00000215375 NACADO15069 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
ATP5D-201ENST00000215375 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.09■■■■■ 4.01
ATP5D-201ENST00000215375 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.05■■■■■ 4
ATP5D-201ENST00000215375 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
ATP5D-201ENST00000215375 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.81■■■■□ 3.96
ATP5D-201ENST00000215375 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.67■■■■□ 3.94
ATP5D-201ENST00000215375 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.25■■■■□ 3.87
ATP5D-201ENST00000215375 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.2■■■■□ 3.875e-7■□□□□ 10.4
ATP5D-201ENST00000215375 SCRIBQ14160 1630 aa39.07■■■■□ 3.85
ATP5D-201ENST00000215375 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.78■■■■□ 3.8
ATP5D-201ENST00000215375 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.75■■■■□ 3.79
ATP5D-201ENST00000215375 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
ATP5D-201ENST00000215375 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.09■■■■□ 3.69
ATP5D-201ENST00000215375 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.79■■■■□ 3.64
ATP5D-201ENST00000215375 SMARCA4P51532 1647 aa37.39■■■■□ 3.58
ATP5D-201ENST00000215375 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
ATP5D-201ENST00000215375 NCAPD3P42695 1498 aa37.19■■■■□ 3.54
ATP5D-201ENST00000215375 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.18■■■■□ 3.54
ATP5D-201ENST00000215375 SMARCA2P51531 1590 aa37.14■■■■□ 3.54
ATP5D-201ENST00000215375 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.06■■■■□ 3.52
ATP5D-201ENST00000215375 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.04■■■■□ 3.52
ATP5D-201ENST00000215375 HMGXB3Q12766 1538 aa37.03■■■■□ 3.52
ATP5D-201ENST00000215375 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
ATP5D-201ENST00000215375 WIZO95785 1651 aa36.7■■■■□ 3.47
ATP5D-201ENST00000215375 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
ATP5D-201ENST00000215375 NESP48681 1621 aa36.36■■■■□ 3.41
ATP5D-201ENST00000215375 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.27■■■■□ 3.4
ATP5D-201ENST00000215375 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
ATP5D-201ENST00000215375 ERCC6Q03468 1493 aa36.22■■■■□ 3.39
ATP5D-201ENST00000215375 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.06■■■■□ 3.36
ATP5D-201ENST00000215375 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.02■■■■□ 3.36
ATP5D-201ENST00000215375 CUX2O14529 1486 aa35.96■■■■□ 3.35
ATP5D-201ENST00000215375 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.95■■■■□ 3.35
ATP5D-201ENST00000215375 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
ATP5D-201ENST00000215375 CFTRP13569 1480 aa35.85■■■■□ 3.33
ATP5D-201ENST00000215375 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.8■■■■□ 3.32
ATP5D-201ENST00000215375 PRDM2Q13029 1718 aa35.73■■■■□ 3.31
ATP5D-201ENST00000215375 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.67■■■■□ 3.3
ATP5D-201ENST00000215375 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.64■■■■□ 3.3
ATP5D-201ENST00000215375 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.63■■■■□ 3.29
ATP5D-201ENST00000215375 WDR62O43379 1518 aa35.57■■■■□ 3.28
ATP5D-201ENST00000215375 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
ATP5D-201ENST00000215375 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
ATP5D-201ENST00000215375 TOPBP1Q92547 1522 aa35.1■■■■□ 3.21
ATP5D-201ENST00000215375 ABCC8Q09428 1581 aa35.07■■■■□ 3.2
ATP5D-201ENST00000215375 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.06■■■■□ 3.2
ATP5D-201ENST00000215375 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.01■■■■□ 3.2
ATP5D-201ENST00000215375 IFT140Q96RY7 1462 aa34.9■■■■□ 3.18
ATP5D-201ENST00000215375 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
ATP5D-201ENST00000215375 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
ATP5D-201ENST00000215375 CUX1P39880 1505 aa34.78■■■■□ 3.16
ATP5D-201ENST00000215375 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
ATP5D-201ENST00000215375 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
ATP5D-201ENST00000215375 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.67■■■■□ 3.14
ATP5D-201ENST00000215375 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.62■■■■□ 3.13
ATP5D-201ENST00000215375 SOGA1O94964 1423 aa34.59■■■■□ 3.13
ATP5D-201ENST00000215375 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.52■■■■□ 3.126e-9■■■■□ 25.9
ATP5D-201ENST00000215375 WDR97A6NE52 1622 aa34.52■■■■□ 3.12
ATP5D-201ENST00000215375 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.5■■■■□ 3.11
ATP5D-201ENST00000215375 TOP2BQ02880 1626 aa34.46■■■■□ 3.11
ATP5D-201ENST00000215375 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.44■■■■□ 3.1
ATP5D-201ENST00000215375 SYNJ1O43426 1573 aa34.44■■■■□ 3.1
ATP5D-201ENST00000215375 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
ATP5D-201ENST00000215375 OSCARQ8IYS5 282 aa34.36■■■■□ 3.09
ATP5D-201ENST00000215375 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.34■■■■□ 3.09
ATP5D-201ENST00000215375 CHD1O14646 1710 aa34.33■■■■□ 3.09
ATP5D-201ENST00000215375 PBRM1Q86U86 1689 aa34.28■■■■□ 3.08
ATP5D-201ENST00000215375 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.27■■■■□ 3.08
ATP5D-201ENST00000215375 GRIN2BQ13224 1484 aa34.23■■■■□ 3.07
ATP5D-201ENST00000215375 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.22■■■■□ 3.07
ATP5D-201ENST00000215375 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.21■■■■□ 3.07
ATP5D-201ENST00000215375 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
ATP5D-201ENST00000215375 FBLN2P98095 1184 aa34.06■■■■□ 3.04
ATP5D-201ENST00000215375 SYNJ2O15056 1496 aa34.04■■■■□ 3.04
ATP5D-201ENST00000215375 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
ATP5D-201ENST00000215375 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.96■■■■□ 3.03
ATP5D-201ENST00000215375 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.96■■■■□ 3.03
ATP5D-201ENST00000215375 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.96■■■■□ 3.03
ATP5D-201ENST00000215375 ADAMTS12P58397 1594 aa33.94■■■■□ 3.02
ATP5D-201ENST00000215375 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.93■■■■□ 3.02
ATP5D-201ENST00000215375 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.89■■■■□ 3.02
ATP5D-201ENST00000215375 ARHGEF11O15085 1522 aa33.89■■■■□ 3.02
ATP5D-201ENST00000215375 GRIN2AQ12879 1464 aa33.82■■■■□ 3
ATP5D-201ENST00000215375 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.8■■■■□ 3
ATP5D-201ENST00000215375 TRIM41Q8WV44 630 aa33.73■■■□□ 2.99
ATP5D-201ENST00000215375 KIF27Q86VH2 1401 aa33.72■■■□□ 2.99
ATP5D-201ENST00000215375 CEP170Q5SW79 1584 aa33.69■■■□□ 2.98
ATP5D-201ENST00000215375 NUP160Q12769 1436 aa33.68■■■□□ 2.98
ATP5D-201ENST00000215375 CUL7Q14999 1698 aa33.62■■■□□ 2.97
ATP5D-201ENST00000215375 IGF1RP08069 1367 aa33.61■■■□□ 2.97
ATP5D-201ENST00000215375 ARAP1Q96P48 1450 aa33.6■■■□□ 2.97
ATP5D-201ENST00000215375 SHROOM2Q13796 1616 aa33.52■■■□□ 2.96
ATP5D-201ENST00000215375 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.49■■■□□ 2.95
ATP5D-201ENST00000215375 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.45■■■□□ 2.95
ATP5D-201ENST00000215375 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.42■■■□□ 2.94
ATP5D-201ENST00000215375 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms