RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.19■■■□□ 2.9
GLIS1-201ENST00000312233 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
GLIS1-201ENST00000312233 HRCP23327 699 aa29.92■■■□□ 2.38
GLIS1-201ENST00000312233 MYT1Q01538 1121 aa29.44■■■□□ 2.3
GLIS1-201ENST00000312233 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.97■■■□□ 2.23
GLIS1-201ENST00000312233 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
GLIS1-201ENST00000312233 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.75■■■□□ 2.19
GLIS1-201ENST00000312233 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.21■■■□□ 2.11
GLIS1-201ENST00000312233 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
GLIS1-201ENST00000312233 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
GLIS1-201ENST00000312233 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
GLIS1-201ENST00000312233 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.75■■■□□ 2.03
GLIS1-201ENST00000312233 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
GLIS1-201ENST00000312233 NEUROD1Q13562 356 aa27.68■■■□□ 2.02
GLIS1-201ENST00000312233 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
GLIS1-201ENST00000312233 ABCC9O60706 1549 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS1-201ENST00000312233 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS1-201ENST00000312233 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
GLIS1-201ENST00000312233 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.48■■□□□ 1.99
GLIS1-201ENST00000312233 BCL11AQ9H165 835 aa27.41■■□□□ 1.98
GLIS1-201ENST00000312233 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.34■■□□□ 1.97
GLIS1-201ENST00000312233 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
GLIS1-201ENST00000312233 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
GLIS1-201ENST00000312233 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
GLIS1-201ENST00000312233 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.06■■□□□ 1.92
GLIS1-201ENST00000312233 NACADO15069 1562 aa27.01■■□□□ 1.92
GLIS1-201ENST00000312233 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.83■■□□□ 1.89
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GLIS1-201ENST00000312233 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.78■■□□□ 1.88
GLIS1-201ENST00000312233 SCRIBQ14160 1630 aa26.7■■□□□ 1.87
GLIS1-201ENST00000312233 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.52■■□□□ 1.84
GLIS1-201ENST00000312233 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.43■■□□□ 1.82
GLIS1-201ENST00000312233 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
GLIS1-201ENST00000312233 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.36■■□□□ 1.81
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM41Q8WV44 630 aa26.32■■□□□ 1.8
GLIS1-201ENST00000312233 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GLIS1-201ENST00000312233 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GLIS1-201ENST00000312233 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.24■■□□□ 1.79
GLIS1-201ENST00000312233 APLP2Q06481 763 aa26.24■■□□□ 1.79
GLIS1-201ENST00000312233 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.09■■□□□ 1.77
GLIS1-201ENST00000312233 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
GLIS1-201ENST00000312233 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
GLIS1-201ENST00000312233 MIER1Q8N108 512 aa26.01■■□□□ 1.76
GLIS1-201ENST00000312233 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26■■□□□ 1.75
GLIS1-201ENST00000312233 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.85■■□□□ 1.73
GLIS1-201ENST00000312233 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
GLIS1-201ENST00000312233 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.67■■□□□ 1.7
GLIS1-201ENST00000312233 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
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GLIS1-201ENST00000312233 SMARCA4P51532 1647 aa25.55■■□□□ 1.68
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GLIS1-201ENST00000312233 WIZO95785 1651 aa25.46■■□□□ 1.67
GLIS1-201ENST00000312233 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.43■■□□□ 1.66
GLIS1-201ENST00000312233 MSH5O43196 834 aa25.42■■□□□ 1.66
GLIS1-201ENST00000312233 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
GLIS1-201ENST00000312233 BCANQ96GW7 911 aa25.3■■□□□ 1.64
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GLIS1-201ENST00000312233 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.23■■□□□ 1.63
GLIS1-201ENST00000312233 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GLIS1-201ENST00000312233 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GLIS1-201ENST00000312233 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.2■■□□□ 1.62
GLIS1-201ENST00000312233 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.17■■□□□ 1.62
GLIS1-201ENST00000312233 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
GLIS1-201ENST00000312233 FKBP8Q14318 412 aa25.13■■□□□ 1.61
GLIS1-201ENST00000312233 SMARCA2P51531 1590 aa25.11■■□□□ 1.61
GLIS1-201ENST00000312233 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.1■■□□□ 1.61
GLIS1-201ENST00000312233 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.08■■□□□ 1.61
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.06■■□□□ 1.6
GLIS1-201ENST00000312233 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GLIS1-201ENST00000312233 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.97■■□□□ 1.59
GLIS1-201ENST00000312233 NCAPD3P42695 1498 aa24.95■■□□□ 1.59
GLIS1-201ENST00000312233 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
GLIS1-201ENST00000312233 ITGAEP38570 1179 aa24.94■■□□□ 1.58
GLIS1-201ENST00000312233 HMGXB3Q12766 1538 aa24.91■■□□□ 1.58
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.91■■□□□ 1.58
GLIS1-201ENST00000312233 NEFLP07196 543 aa24.82■■□□□ 1.56
GLIS1-201ENST00000312233 KCNH8Q96L42 1107 aa24.81■■□□□ 1.56
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GLIS1-201ENST00000312233 IL27Q8NEV9 243 aa24.69■■□□□ 1.54
GLIS1-201ENST00000312233 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GLIS1-201ENST00000312233 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GLIS1-201ENST00000312233 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
GLIS1-201ENST00000312233 NBR1Q14596 966 aa24.61■■□□□ 1.53
GLIS1-201ENST00000312233 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
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GLIS1-201ENST00000312233 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.53■■□□□ 1.52
GLIS1-201ENST00000312233 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.53■■□□□ 1.52
GLIS1-201ENST00000312233 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GLIS1-201ENST00000312233 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
GLIS1-201ENST00000312233 ABCC8Q09428 1581 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS1-201ENST00000312233 CFTRP13569 1480 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM52Q96A61 297 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS1-201ENST00000312233 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GLIS1-201ENST00000312233 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GLIS1-201ENST00000312233 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.32■■□□□ 1.48
GLIS1-201ENST00000312233 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.31■■□□□ 1.48
GLIS1-201ENST00000312233 SLC24A1O60721 1099 aa24.3■■□□□ 1.48
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