RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.5■■■■■ 5.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC9O60706 1549 aa43.56■■■■■ 4.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.46■■■■■ 4.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.45■■■■■ 4.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NACADO15069 1562 aa41.17■■■■■ 4.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.05■■■■■ 4.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.97■■■■■ 4.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.62■■■■■ 4.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.62■■■■■ 4.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.38■■■■■ 4.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.21■■■■■ 4.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.08■■■■■ 4.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.73■■■■□ 3.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCRIBQ14160 1630 aa39.59■■■■□ 3.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.32■■■■□ 3.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.27■■■■□ 3.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCAPD3P42695 1498 aa38.06■■■■□ 3.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.9■■■■□ 3.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMARCA4P51532 1647 aa37.79■■■■□ 3.64
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMARCA2P51531 1590 aa37.78■■■■□ 3.64
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.7■■■■□ 3.63
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMGXB3Q12766 1538 aa37.7■■■■□ 3.63
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERCC6Q03468 1493 aa37.64■■■■□ 3.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUX2O14529 1486 aa37.58■■■■□ 3.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.45■■■■□ 3.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NESP48681 1621 aa37.39■■■■□ 3.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.34■■■■□ 3.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.14■■■■□ 3.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.01■■■■□ 3.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.91■■■■□ 3.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WIZO95785 1651 aa36.85■■■■□ 3.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.83■■■■□ 3.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.62■■■■□ 3.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR62O43379 1518 aa36.51■■■■□ 3.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.47■■■■□ 3.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFTRP13569 1480 aa36.44■■■■□ 3.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.44■■■■□ 3.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.05■■■■□ 3.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM41Q8WV44 630 aa35.98■■■■□ 3.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OSCARQ8IYS5 282 aa35.97■■■■□ 3.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRDM2Q13029 1718 aa35.92■■■■□ 3.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFT140Q96RY7 1462 aa35.78■■■■□ 3.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOPBP1Q92547 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC8Q09428 1581 aa35.72■■■■□ 3.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.57■■■■□ 3.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.39■■■■□ 3.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOGA1O94964 1423 aa35.26■■■■□ 3.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF11O15085 1522 aa35.26■■■■□ 3.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.24■■■■□ 3.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBLN2P98095 1184 aa35.22■■■■□ 3.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHD1O14646 1710 aa35.14■■■■□ 3.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.13■■■■□ 3.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.1■■■■□ 3.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUX1P39880 1505 aa35.08■■■■□ 3.21
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR97A6NE52 1622 aa35.05■■■■□ 3.2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.99■■■■□ 3.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRIN2BQ13224 1484 aa34.94■■■■□ 3.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARAP1Q96P48 1450 aa34.9■■■■□ 3.18
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYNJ2O15056 1496 aa34.81■■■■□ 3.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.81■■■■□ 3.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.8■■■■□ 3.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYNJ1O43426 1573 aa34.79■■■■□ 3.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.76■■■■□ 3.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PBRM1Q86U86 1689 aa34.66■■■■□ 3.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.65■■■■□ 3.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.63■■■■□ 3.13
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOP2BQ02880 1626 aa34.51■■■■□ 3.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.48■■■■□ 3.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRIN2AQ12879 1464 aa34.46■■■■□ 3.11
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.38■■■■□ 3.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAMTS12P58397 1594 aa34.37■■■■□ 3.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUP160Q12769 1436 aa34.37■■■■□ 3.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.31■■■■□ 3.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP170Q5SW79 1584 aa34.29■■■■□ 3.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.23■■■■□ 3.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHROOM2Q13796 1616 aa34.15■■■■□ 3.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 JPH4Q96JJ6 628 aa34.1■■■■□ 3.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGF1RP08069 1367 aa33.94■■■■□ 3.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF27Q86VH2 1401 aa33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms