RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.19■■■□□ 2.9
GLIS1-202ENST00000628545 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
GLIS1-202ENST00000628545 HRCP23327 699 aa29.95■■■□□ 2.39
GLIS1-202ENST00000628545 MYT1Q01538 1121 aa29.44■■■□□ 2.3
GLIS1-202ENST00000628545 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
GLIS1-202ENST00000628545 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.08■■■□□ 2.25
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.97■■■□□ 2.23
GLIS1-202ENST00000628545 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
GLIS1-202ENST00000628545 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.69■■■□□ 2.18
GLIS1-202ENST00000628545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
GLIS1-202ENST00000628545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.52■■■□□ 2.16
GLIS1-202ENST00000628545 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.33■■■□□ 2.13
GLIS1-202ENST00000628545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.2■■■□□ 2.1
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
GLIS1-202ENST00000628545 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
GLIS1-202ENST00000628545 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
GLIS1-202ENST00000628545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
GLIS1-202ENST00000628545 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
GLIS1-202ENST00000628545 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.73■■■□□ 2.03
GLIS1-202ENST00000628545 NEUROD1Q13562 356 aa27.68■■■□□ 2.02
GLIS1-202ENST00000628545 ABCC9O60706 1549 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS1-202ENST00000628545 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS1-202ENST00000628545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.48■■□□□ 1.99
GLIS1-202ENST00000628545 BCL11AQ9H165 835 aa27.41■■□□□ 1.98
GLIS1-202ENST00000628545 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
GLIS1-202ENST00000628545 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
GLIS1-202ENST00000628545 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
GLIS1-202ENST00000628545 NACADO15069 1562 aa27.01■■□□□ 1.92
GLIS1-202ENST00000628545 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
GLIS1-202ENST00000628545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.83■■□□□ 1.89
GLIS1-202ENST00000628545 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.78■■□□□ 1.88
GLIS1-202ENST00000628545 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
GLIS1-202ENST00000628545 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GLIS1-202ENST00000628545 SCRIBQ14160 1630 aa26.7■■□□□ 1.87
GLIS1-202ENST00000628545 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM41Q8WV44 630 aa26.55■■□□□ 1.84
GLIS1-202ENST00000628545 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.52■■□□□ 1.84
GLIS1-202ENST00000628545 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.43■■□□□ 1.82
GLIS1-202ENST00000628545 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.38■■□□□ 1.81
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
GLIS1-202ENST00000628545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.36■■□□□ 1.81
GLIS1-202ENST00000628545 MIER1Q8N108 512 aa26.27■■□□□ 1.8
GLIS1-202ENST00000628545 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.24■■□□□ 1.79
GLIS1-202ENST00000628545 APLP2Q06481 763 aa26.24■■□□□ 1.79
GLIS1-202ENST00000628545 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GLIS1-202ENST00000628545 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.09■■□□□ 1.77
GLIS1-202ENST00000628545 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.03■■□□□ 1.76
GLIS1-202ENST00000628545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
GLIS1-202ENST00000628545 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.85■■□□□ 1.73
GLIS1-202ENST00000628545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
GLIS1-202ENST00000628545 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.67■■□□□ 1.7
GLIS1-202ENST00000628545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
GLIS1-202ENST00000628545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
GLIS1-202ENST00000628545 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GLIS1-202ENST00000628545 SMARCA4P51532 1647 aa25.55■■□□□ 1.68
GLIS1-202ENST00000628545 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
GLIS1-202ENST00000628545 BCANQ96GW7 911 aa25.49■■□□□ 1.67
GLIS1-202ENST00000628545 WIZO95785 1651 aa25.46■■□□□ 1.67
GLIS1-202ENST00000628545 MSH5O43196 834 aa25.42■■□□□ 1.66
GLIS1-202ENST00000628545 CEP162Q5TB80 1403 aa25.4■■□□□ 1.66
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GLIS1-202ENST00000628545 FKBP8Q14318 412 aa25.31■■□□□ 1.64
GLIS1-202ENST00000628545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
GLIS1-202ENST00000628545 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.24■■□□□ 1.63
GLIS1-202ENST00000628545 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.23■■□□□ 1.63
GLIS1-202ENST00000628545 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GLIS1-202ENST00000628545 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GLIS1-202ENST00000628545 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.2■■□□□ 1.62
GLIS1-202ENST00000628545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.17■■□□□ 1.62
GLIS1-202ENST00000628545 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.15■■□□□ 1.62
GLIS1-202ENST00000628545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
GLIS1-202ENST00000628545 KCNH8Q96L42 1107 aa25.14■■□□□ 1.62
GLIS1-202ENST00000628545 SMARCA2P51531 1590 aa25.11■■□□□ 1.61
GLIS1-202ENST00000628545 ITGAEP38570 1179 aa25.1■■□□□ 1.61
GLIS1-202ENST00000628545 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.1■■□□□ 1.61
GLIS1-202ENST00000628545 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.08■■□□□ 1.61
GLIS1-202ENST00000628545 NEFLP07196 543 aa25.07■■□□□ 1.6
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.06■■□□□ 1.6
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GLIS1-202ENST00000628545 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
GLIS1-202ENST00000628545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.97■■□□□ 1.59
GLIS1-202ENST00000628545 NCAPD3P42695 1498 aa24.95■■□□□ 1.59
GLIS1-202ENST00000628545 ABCC8Q09428 1581 aa24.94■■□□□ 1.58
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.94■■□□□ 1.58
GLIS1-202ENST00000628545 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GLIS1-202ENST00000628545 HMGXB3Q12766 1538 aa24.91■■□□□ 1.58
GLIS1-202ENST00000628545 SOGA1O94964 1423 aa24.89■■□□□ 1.57
GLIS1-202ENST00000628545 GOLGA3Q08378 1498 aa24.77■■□□□ 1.56
GLIS1-202ENST00000628545 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
GLIS1-202ENST00000628545 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM52Q96A61 297 aa24.73■■□□□ 1.55
GLIS1-202ENST00000628545 EEA1Q15075 1411 aa24.73■■□□□ 1.55
GLIS1-202ENST00000628545 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.72■■□□□ 1.55
GLIS1-202ENST00000628545 IL27Q8NEV9 243 aa24.69■■□□□ 1.54
GLIS1-202ENST00000628545 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GLIS1-202ENST00000628545 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
GLIS1-202ENST00000628545 CLIP1P30622 1438 aa24.64■■□□□ 1.53
GLIS1-202ENST00000628545 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.64■■□□□ 1.53
GLIS1-202ENST00000628545 NBR1Q14596 966 aa24.61■■□□□ 1.53
GLIS1-202ENST00000628545 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
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