RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.09■■■■■ 5.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.9■■■■■ 4.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC9O60706 1549 aa42.1■■■■■ 4.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.43■■■■■ 4.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NACADO15069 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.09■■■■■ 4.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.04■■■■■ 4
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.79■■■■□ 3.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.6■■■■□ 3.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.26■■■■□ 3.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.25■■■■□ 3.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCRIBQ14160 1630 aa39.11■■■■□ 3.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.8■■■■□ 3.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.79■■■■□ 3.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.11■■■■□ 3.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.85■■■■□ 3.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMARCA4P51532 1647 aa37.39■■■■□ 3.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.2■■■■□ 3.55
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCAPD3P42695 1498 aa37.2■■■■□ 3.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMARCA2P51531 1590 aa37.15■■■■□ 3.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.08■■■■□ 3.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGXB3Q12766 1538 aa37.05■■■■□ 3.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.04■■■■□ 3.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 WIZO95785 1651 aa36.67■■■■□ 3.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 NESP48681 1621 aa36.4■■■■□ 3.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERCC6Q03468 1493 aa36.28■■■■□ 3.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.27■■■■□ 3.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.07■■■■□ 3.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.01■■■■□ 3.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUX2O14529 1486 aa36■■■■□ 3.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.98■■■■□ 3.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFTRP13569 1480 aa35.86■■■■□ 3.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.8■■■■□ 3.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDM2Q13029 1718 aa35.66■■■■□ 3.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR62O43379 1518 aa35.6■■■■□ 3.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOPBP1Q92547 1522 aa35.12■■■■□ 3.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.08■■■■□ 3.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.05■■■■□ 3.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC8Q09428 1581 aa35.04■■■■□ 3.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFT140Q96RY7 1462 aa34.93■■■■□ 3.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUX1P39880 1505 aa34.8■■■■□ 3.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.7■■■■□ 3.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.65■■■■□ 3.14
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOGA1O94964 1423 aa34.6■■■■□ 3.13
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR97A6NE52 1622 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.48■■■■□ 3.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.46■■■■□ 3.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNJ1O43426 1573 aa34.45■■■■□ 3.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOP2BQ02880 1626 aa34.44■■■■□ 3.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSCARQ8IYS5 282 aa34.36■■■■□ 3.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHD1O14646 1710 aa34.32■■■■□ 3.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.29■■■■□ 3.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.27■■■■□ 3.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIN2BQ13224 1484 aa34.26■■■■□ 3.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PBRM1Q86U86 1689 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.22■■■■□ 3.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBLN2P98095 1184 aa34.09■■■■□ 3.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNJ2O15056 1496 aa34.07■■■■□ 3.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.98■■■■□ 3.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.98■■■■□ 3.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.98■■■■□ 3.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS12P58397 1594 aa33.98■■■■□ 3.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF11O15085 1522 aa33.94■■■■□ 3.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.94■■■■□ 3.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.93■■■■□ 3.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIN2AQ12879 1464 aa33.83■■■■□ 3.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.82■■■■□ 3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM41Q8WV44 630 aa33.8■■■■□ 3
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF27Q86VH2 1401 aa33.73■■■□□ 2.99
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP170Q5SW79 1584 aa33.72■■■□□ 2.99
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP160Q12769 1436 aa33.7■■■□□ 2.99
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARAP1Q96P48 1450 aa33.66■■■□□ 2.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUL7Q14999 1698 aa33.61■■■□□ 2.97
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGF1RP08069 1367 aa33.6■■■□□ 2.97
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHROOM2Q13796 1616 aa33.52■■■□□ 2.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.51■■■□□ 2.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.48■■■□□ 2.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.45■■■□□ 2.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.39■■■□□ 2.94
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