RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.34■■■■■ 5.01
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HOXD11-201ENST00000249504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
HOXD11-201ENST00000249504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.62■■■■□ 3.77
HOXD11-201ENST00000249504 NACADO15069 1562 aa38.52■■■■□ 3.76
HOXD11-201ENST00000249504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.49■■■■□ 3.75
HOXD11-201ENST00000249504 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.37■■■■□ 3.73
HOXD11-201ENST00000249504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.35■■■■□ 3.73
HOXD11-201ENST00000249504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.64■■■■□ 3.62
HOXD11-201ENST00000249504 SCRIBQ14160 1630 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXD11-201ENST00000249504 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.27■■■■□ 3.56
HOXD11-201ENST00000249504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.26■■■■□ 3.55
HOXD11-201ENST00000249504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.92■■■■□ 3.5
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.13■■■■□ 3.38
HOXD11-201ENST00000249504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.05■■■■□ 3.36
HOXD11-201ENST00000249504 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.05■■■■□ 3.36
HOXD11-201ENST00000249504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
HOXD11-201ENST00000249504 SMARCA4P51532 1647 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXD11-201ENST00000249504 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXD11-201ENST00000249504 SMARCA2P51531 1590 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXD11-201ENST00000249504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXD11-201ENST00000249504 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXD11-201ENST00000249504 NCAPD3P42695 1498 aa35.49■■■■□ 3.27
HOXD11-201ENST00000249504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
HOXD11-201ENST00000249504 HMGXB3Q12766 1538 aa35.4■■■■□ 3.26
HOXD11-201ENST00000249504 WIZO95785 1651 aa35.39■■■■□ 3.26
HOXD11-201ENST00000249504 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
HOXD11-201ENST00000249504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
HOXD11-201ENST00000249504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.59■■■■□ 3.13
HOXD11-201ENST00000249504 NESP48681 1621 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXD11-201ENST00000249504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXD11-201ENST00000249504 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXD11-201ENST00000249504 CFTRP13569 1480 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD11-201ENST00000249504 ERCC6Q03468 1493 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXD11-201ENST00000249504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXD11-201ENST00000249504 PRDM2Q13029 1718 aa34.24■■■■□ 3.07
HOXD11-201ENST00000249504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXD11-201ENST00000249504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXD11-201ENST00000249504 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.07■■■■□ 3.04
HOXD11-201ENST00000249504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
HOXD11-201ENST00000249504 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.93■■■■□ 3.02
HOXD11-201ENST00000249504 CUX2O14529 1486 aa33.8■■■■□ 3
HOXD11-201ENST00000249504 WDR62O43379 1518 aa33.8■■■■□ 3
HOXD11-201ENST00000249504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
HOXD11-201ENST00000249504 ABCC8Q09428 1581 aa33.64■■■□□ 2.98
HOXD11-201ENST00000249504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXD11-201ENST00000249504 TOPBP1Q92547 1522 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXD11-201ENST00000249504 CUX1P39880 1505 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXD11-201ENST00000249504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.94
HOXD11-201ENST00000249504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
HOXD11-201ENST00000249504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.35■■■□□ 2.93
HOXD11-201ENST00000249504 SYNJ1O43426 1573 aa33.33■■■□□ 2.93
HOXD11-201ENST00000249504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.33■■■□□ 2.93
HOXD11-201ENST00000249504 TOP2BQ02880 1626 aa33.32■■■□□ 2.93
HOXD11-201ENST00000249504 IFT140Q96RY7 1462 aa33.32■■■□□ 2.93
HOXD11-201ENST00000249504 SOGA1O94964 1423 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXD11-201ENST00000249504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
HOXD11-201ENST00000249504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
HOXD11-201ENST00000249504 WDR97A6NE52 1622 aa33.07■■■□□ 2.88
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
HOXD11-201ENST00000249504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.03■■■□□ 2.88
HOXD11-201ENST00000249504 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.02■■■□□ 2.88
HOXD11-201ENST00000249504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
HOXD11-201ENST00000249504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM41Q8WV44 630 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXD11-201ENST00000249504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXD11-201ENST00000249504 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.86■■■□□ 2.85
HOXD11-201ENST00000249504 PBRM1Q86U86 1689 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXD11-201ENST00000249504 GRIN2BQ13224 1484 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXD11-201ENST00000249504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD11-201ENST00000249504 KIF27Q86VH2 1401 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD11-201ENST00000249504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
HOXD11-201ENST00000249504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD11-201ENST00000249504 CHD1O14646 1710 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXD11-201ENST00000249504 FBLN2P98095 1184 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTS12P58397 1594 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD11-201ENST00000249504 SYNJ2O15056 1496 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD11-201ENST00000249504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.8
HOXD11-201ENST00000249504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXD11-201ENST00000249504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.49■■■□□ 2.79
HOXD11-201ENST00000249504 IGF1RP08069 1367 aa32.48■■■□□ 2.79
HOXD11-201ENST00000249504 CUL7Q14999 1698 aa32.46■■■□□ 2.79
HOXD11-201ENST00000249504 OSCARQ8IYS5 282 aa32.45■■■□□ 2.78
HOXD11-201ENST00000249504 GRIN2AQ12879 1464 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXD11-201ENST00000249504 EEA1Q15075 1411 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXD11-201ENST00000249504 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD11-201ENST00000249504 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD11-201ENST00000249504 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD11-201ENST00000249504 CEP170Q5SW79 1584 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD11-201ENST00000249504 NUP160Q12769 1436 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXD11-201ENST00000249504 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXD11-201ENST00000249504 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD11-201ENST00000249504 PRXQ9BXM0 1461 aa32.15■■■□□ 2.74
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.99■■■□□ 2.71
HOXD11-201ENST00000249504 KIF21BO75037 1637 aa31.99■■■□□ 2.71
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