Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)7.54□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DTNA-218ENST00000590598 682 ntTSL 57.24□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)5.87□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 RAD51D-207ENST00000585947 672 ntTSL 35.77□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ZNF577-213ENST00000639416 334 ntTSL 25.11□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.651e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 RAD51D-214ENST00000587982 682 ntTSL 54.59□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 MAGI2-226ENST00000636424 102 ntTSL 51□□□□□ -2.251e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 MEIS2-205ENST00000397624 2748 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ACTN4-208ENST00000497637 877 ntTSL 217.3■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 511.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ACTN4-205ENST00000477174 544 ntTSL 310.36□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 XXYLT1-210ENST00000491138 738 ntTSL 318.17■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 XXYLT1-203ENST00000418940 582 ntTSL 414.28□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 XXYLT1-211ENST00000494175 565 ntTSL 413.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 XXYLT1-209ENST00000476897 551 ntTSL 410.74□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 EPB41L1-219ENST00000636016 6665 ntTSL 29.14□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 59.07□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 TMEM144-208ENST00000508243 1070 ntTSL 59.43□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 TMEM144-201ENST00000296529 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 TMEM144-211ENST00000511532 2861 ntTSL 1 (best)3.23□□□□□ -1.894e-6■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-209ENST00000378702 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-206ENST00000361471 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-212ENST00000378723 4645 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-210ENST00000378705 714 ntTSL 57.85□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-204ENST00000358062 6773 ntTSL 56.25□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.494e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.764e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.764e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.924e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 SNX13-204ENST00000444712 2018 ntTSL 514.13□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ABCB1-207ENST00000488737 1864 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ABCB1-209ENST00000496821 913 ntTSL 511.98□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ABCB1-201ENST00000265724 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.995e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.135e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 ABCB1-211ENST00000622132 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 SNX13-201ENST00000409076 3818 ntTSL 27.45□□□□□ -1.223e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.473e-8■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 MOB1B-205ENST00000511449 627 ntTSL 312.73□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 MOB1B-203ENST00000502869 760 ntTSL 311.9□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 MOB1B-204ENST00000509041 2056 ntTSL 29.49□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.543e-7■■■■■ 29.3
PTBP1P26599 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 216.95■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NDST1-206ENST00000522491 777 ntTSL 216.24■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NCKIPSD-206ENST00000439518 1214 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 515.02■□□□□ -03e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VARS2-204ENST00000467717 863 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 ATP6V0A2-202ENST00000504192 2525 ntTSL 512.8□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NCKIPSD-208ENST00000454134 998 ntTSL 312.39□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VARS2-203ENST00000428017 1103 ntTSL 212.27□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RBBP4-218ENST00000527118 700 ntTSL 311.73□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NCKIPSD-207ENST00000453349 889 ntTSL 311.72□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 211.36□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RBBP4-205ENST00000445722 580 ntTSL 211.22□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 NCKIPSD-205ENST00000426678 897 ntTSL 511.1□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GPD2-213ENST00000540309 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 FAM96A-205ENST00000559705 636 ntTSL 39.9□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RBBP4-215ENST00000524393 583 ntTSL 39.55□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RBBP4-203ENST00000401893 762 ntTSL 29.55□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RBBP4-213ENST00000490500 632 ntTSL 39.24□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 VARS2-210ENST00000490699 719 ntTSL 39.12□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 RBBP4-216ENST00000525506 501 ntTSL 28.1□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 CADM2-203ENST00000407528 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.264e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 ATP6V0A2-208ENST00000545059 4232 ntTSL 57.09□□□□□ -1.274e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 GPD2-204ENST00000409861 2640 ntTSL 57.09□□□□□ -1.274e-6■■■■■ 29.2
PTBP1P26599 ATP6V0A2-204ENST00000536426 742 ntTSL 57.07□□□□□ -1.284e-6■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 295.6 ms