Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNH3Q9ULD8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNH3Q9ULD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNH3Q9ULD8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KCNH3Q9ULD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms