Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COA4Q9NYJ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COA4Q9NYJ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COA4Q9NYJ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COA4Q9NYJ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms