Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFDN4Q9NQP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN4Q9NQP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN4Q9NQP4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFDN4Q9NQP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms