Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ66

PLCB1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB1Q9NQ66 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLCB1Q9NQ66 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLCB1Q9NQ66 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCB1Q9NQ66 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLCB1Q9NQ66 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms