Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM138Q9NPI0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM138Q9NPI0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM138Q9NPI0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms