Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FERMT1Q9BQL6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
FERMT1Q9BQL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FERMT1Q9BQL6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FERMT1Q9BQL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FERMT1Q9BQL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms