Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN4Q96NZ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXN4Q96NZ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms