Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT9Q86SS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT9Q86SS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms