Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SRCAPQ6ZRS2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SRCAPQ6ZRS2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SRCAPQ6ZRS2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SRCAPQ6ZRS2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SRCAPQ6ZRS2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SRCAPQ6ZRS2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SRCAPQ6ZRS2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SRCAPQ6ZRS2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms