RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217074.8

PABPC1L-202, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PABPC1L, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L-202ENST00000217074 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.79■■■■■ 6.68
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PABPC1L-202ENST00000217074 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.8■■■■■ 5.72
PABPC1L-202ENST00000217074 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.4■■■■■ 5.34
PABPC1L-202ENST00000217074 NACADO15069 1562 aa48.12■■■■■ 5.29
PABPC1L-202ENST00000217074 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.95■■■■■ 5.27
PABPC1L-202ENST00000217074 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.94■■■■■ 5.26
PABPC1L-202ENST00000217074 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.52■■■■■ 5.2
PABPC1L-202ENST00000217074 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.49■■■■■ 5.19
PABPC1L-202ENST00000217074 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.21■■■■■ 5.15
PABPC1L-202ENST00000217074 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.08■■■■■ 5.13
PABPC1L-202ENST00000217074 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
PABPC1L-202ENST00000217074 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.91■■■■■ 5.1
PABPC1L-202ENST00000217074 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.39■■■■■ 5.02
PABPC1L-202ENST00000217074 SCRIBQ14160 1630 aa46.32■■■■■ 5
PABPC1L-202ENST00000217074 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.95■■■■■ 4.95
PABPC1L-202ENST00000217074 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.93
PABPC1L-202ENST00000217074 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.87■■■■■ 4.93
PABPC1L-202ENST00000217074 NCAPD3P42695 1498 aa44.53■■■■■ 4.72
PABPC1L-202ENST00000217074 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.36■■■■■ 4.69
PABPC1L-202ENST00000217074 SMARCA4P51532 1647 aa44.21■■■■■ 4.67
PABPC1L-202ENST00000217074 SMARCA2P51531 1590 aa44.14■■■■■ 4.66
PABPC1L-202ENST00000217074 HMGXB3Q12766 1538 aa44.08■■■■■ 4.65
PABPC1L-202ENST00000217074 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
PABPC1L-202ENST00000217074 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.97■■■■■ 4.63
PABPC1L-202ENST00000217074 ERCC6Q03468 1493 aa43.89■■■■■ 4.62
PABPC1L-202ENST00000217074 CUX2O14529 1486 aa43.86■■■■■ 4.61
PABPC1L-202ENST00000217074 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
PABPC1L-202ENST00000217074 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.84■■■■■ 4.61
PABPC1L-202ENST00000217074 NESP48681 1621 aa43.77■■■■■ 4.6
PABPC1L-202ENST00000217074 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.76■■■■■ 4.6
PABPC1L-202ENST00000217074 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.39■■■■■ 4.54
PABPC1L-202ENST00000217074 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
PABPC1L-202ENST00000217074 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.21■■■■■ 4.51
PABPC1L-202ENST00000217074 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.16■■■■■ 4.5
PABPC1L-202ENST00000217074 WIZO95785 1651 aa43.15■■■■■ 4.5
PABPC1L-202ENST00000217074 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.05■■■■■ 4.48
PABPC1L-202ENST00000217074 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
PABPC1L-202ENST00000217074 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.8■■■■■ 4.44
PABPC1L-202ENST00000217074 WDR62O43379 1518 aa42.68■■■■■ 4.42
PABPC1L-202ENST00000217074 CFTRP13569 1480 aa42.66■■■■■ 4.42
PABPC1L-202ENST00000217074 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
PABPC1L-202ENST00000217074 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.62■■■■■ 4.41
PABPC1L-202ENST00000217074 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.61■■■■■ 4.41
PABPC1L-202ENST00000217074 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
PABPC1L-202ENST00000217074 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.23■■■■■ 4.35
PABPC1L-202ENST00000217074 OSCARQ8IYS5 282 aa41.96■■■■■ 4.31
PABPC1L-202ENST00000217074 PRDM2Q13029 1718 aa41.95■■■■■ 4.31
PABPC1L-202ENST00000217074 TRIM41Q8WV44 630 aa41.94■■■■■ 4.3
PABPC1L-202ENST00000217074 TOPBP1Q92547 1522 aa41.8■■■■■ 4.28
PABPC1L-202ENST00000217074 IFT140Q96RY7 1462 aa41.8■■■■■ 4.28
PABPC1L-202ENST00000217074 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
PABPC1L-202ENST00000217074 ABCC8Q09428 1581 aa41.71■■■■■ 4.27
PABPC1L-202ENST00000217074 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.6■■■■■ 4.25
PABPC1L-202ENST00000217074 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
PABPC1L-202ENST00000217074 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
PABPC1L-202ENST00000217074 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.222e-7■■■■■ 27.5
PABPC1L-202ENST00000217074 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
PABPC1L-202ENST00000217074 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
PABPC1L-202ENST00000217074 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
PABPC1L-202ENST00000217074 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
PABPC1L-202ENST00000217074 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.26■■■■■ 4.2
PABPC1L-202ENST00000217074 SOGA1O94964 1423 aa41.24■■■■■ 4.19
PABPC1L-202ENST00000217074 ARHGEF11O15085 1522 aa41.18■■■■■ 4.18
PABPC1L-202ENST00000217074 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
PABPC1L-202ENST00000217074 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.11■■■■■ 4.17
PABPC1L-202ENST00000217074 FBLN2P98095 1184 aa41.1■■■■■ 4.17
PABPC1L-202ENST00000217074 CUX1P39880 1505 aa41.09■■■■■ 4.17
PABPC1L-202ENST00000217074 CHD1O14646 1710 aa41.04■■■■■ 4.16
PABPC1L-202ENST00000217074 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
PABPC1L-202ENST00000217074 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.97■■■■■ 4.15
PABPC1L-202ENST00000217074 WDR97A6NE52 1622 aa40.93■■■■■ 4.14
PABPC1L-202ENST00000217074 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.92■■■■■ 4.14
PABPC1L-202ENST00000217074 GRIN2BQ13224 1484 aa40.83■■■■■ 4.13
PABPC1L-202ENST00000217074 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
PABPC1L-202ENST00000217074 ARAP1Q96P48 1450 aa40.82■■■■■ 4.12
PABPC1L-202ENST00000217074 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
PABPC1L-202ENST00000217074 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.71■■■■■ 4.11
PABPC1L-202ENST00000217074 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.7■■■■■ 4.11
PABPC1L-202ENST00000217074 SYNJ2O15056 1496 aa40.69■■■■■ 4.1
PABPC1L-202ENST00000217074 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.67■■■■■ 4.1
PABPC1L-202ENST00000217074 SYNJ1O43426 1573 aa40.61■■■■■ 4.09
PABPC1L-202ENST00000217074 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.53■■■■■ 4.08
PABPC1L-202ENST00000217074 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.08
PABPC1L-202ENST00000217074 PBRM1Q86U86 1689 aa40.51■■■■■ 4.08
PABPC1L-202ENST00000217074 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
PABPC1L-202ENST00000217074 TOP2BQ02880 1626 aa40.39■■■■■ 4.06
PABPC1L-202ENST00000217074 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.36■■■■■ 4.05
PABPC1L-202ENST00000217074 GRIN2AQ12879 1464 aa40.3■■■■■ 4.04
PABPC1L-202ENST00000217074 ADAMTS12P58397 1594 aa40.22■■■■■ 4.03
PABPC1L-202ENST00000217074 NUP160Q12769 1436 aa40.21■■■■■ 4.03
PABPC1L-202ENST00000217074 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.2■■■■■ 4.03
PABPC1L-202ENST00000217074 CEP170Q5SW79 1584 aa40.13■■■■■ 4.01
PABPC1L-202ENST00000217074 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.12■■■■■ 4.01
PABPC1L-202ENST00000217074 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.1■■■■■ 4.01
PABPC1L-202ENST00000217074 SHROOM2Q13796 1616 aa39.94■■■■□ 3.99
PABPC1L-202ENST00000217074 JPH4Q96JJ6 628 aa39.87■■■■□ 3.97
PABPC1L-202ENST00000217074 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
PABPC1L-202ENST00000217074 IGF1RP08069 1367 aa39.75■■■■□ 3.95
PABPC1L-202ENST00000217074 KIF27Q86VH2 1401 aa39.65■■■■□ 3.94
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