RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636672.1

AL160276.1-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AL160276.1, Length 1,312 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL160276.1-201ENST00000636672 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.16■■■■■ 6.9
AL160276.1-201ENST00000636672 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.07■■■■■ 5.93
AL160276.1-201ENST00000636672 ABCC9O60706 1549 aa51.48■■■■■ 5.83
AL160276.1-201ENST00000636672 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.28■■■■■ 5.48
AL160276.1-201ENST00000636672 NACADO15069 1562 aa49.05■■■■■ 5.44
AL160276.1-201ENST00000636672 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.77■■■■■ 5.4
AL160276.1-201ENST00000636672 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.54■■■■■ 5.36
AL160276.1-201ENST00000636672 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.31■■■■■ 5.32
AL160276.1-201ENST00000636672 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.24■■■■■ 5.31
AL160276.1-201ENST00000636672 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.1■■■■■ 5.29
AL160276.1-201ENST00000636672 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.95■■■■■ 5.27
AL160276.1-201ENST00000636672 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.82■■■■■ 5.25
AL160276.1-201ENST00000636672 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.81■■■■■ 5.24
AL160276.1-201ENST00000636672 SCRIBQ14160 1630 aa47.4■■■■■ 5.18
AL160276.1-201ENST00000636672 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.25■■■■■ 5.16
AL160276.1-201ENST00000636672 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
AL160276.1-201ENST00000636672 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.58■■■■■ 5.05
AL160276.1-201ENST00000636672 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.33■■■■■ 5.01
AL160276.1-201ENST00000636672 SMARCA4P51532 1647 aa45.29■■■■■ 4.84
AL160276.1-201ENST00000636672 NCAPD3P42695 1498 aa45.24■■■■■ 4.83
AL160276.1-201ENST00000636672 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.17■■■■■ 4.82
AL160276.1-201ENST00000636672 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.81
AL160276.1-201ENST00000636672 SMARCA2P51531 1590 aa45.11■■■■■ 4.81
AL160276.1-201ENST00000636672 HMGXB3Q12766 1538 aa45■■■■■ 4.79
AL160276.1-201ENST00000636672 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.87■■■■■ 4.77
AL160276.1-201ENST00000636672 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.81■■■■■ 4.76
AL160276.1-201ENST00000636672 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
AL160276.1-201ENST00000636672 ERCC6Q03468 1493 aa44.43■■■■■ 4.7
AL160276.1-201ENST00000636672 NESP48681 1621 aa44.37■■■■■ 4.69
AL160276.1-201ENST00000636672 WIZO95785 1651 aa44.32■■■■■ 4.69
AL160276.1-201ENST00000636672 CUX2O14529 1486 aa44.21■■■■■ 4.67
AL160276.1-201ENST00000636672 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.2■■■■■ 4.67
AL160276.1-201ENST00000636672 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
AL160276.1-201ENST00000636672 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.9■■■■■ 4.62
AL160276.1-201ENST00000636672 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
AL160276.1-201ENST00000636672 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.87■■■■■ 4.61
AL160276.1-201ENST00000636672 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.86■■■■■ 4.61
AL160276.1-201ENST00000636672 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
AL160276.1-201ENST00000636672 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.58■■■■■ 4.57
AL160276.1-201ENST00000636672 CFTRP13569 1480 aa43.49■■■■■ 4.55
AL160276.1-201ENST00000636672 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.48■■■■■ 4.55
AL160276.1-201ENST00000636672 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.41■■■■■ 4.54
AL160276.1-201ENST00000636672 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.39■■■■■ 4.54
AL160276.1-201ENST00000636672 WDR62O43379 1518 aa43.38■■■■■ 4.53
AL160276.1-201ENST00000636672 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.25■■■■■ 4.51
AL160276.1-201ENST00000636672 PRDM2Q13029 1718 aa43.24■■■■■ 4.51
AL160276.1-201ENST00000636672 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
AL160276.1-201ENST00000636672 TOPBP1Q92547 1522 aa42.63■■■■■ 4.42
AL160276.1-201ENST00000636672 ABCC8Q09428 1581 aa42.59■■■■■ 4.41
AL160276.1-201ENST00000636672 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.55■■■■■ 4.4
AL160276.1-201ENST00000636672 IFT140Q96RY7 1462 aa42.51■■■■■ 4.4
AL160276.1-201ENST00000636672 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.38
AL160276.1-201ENST00000636672 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
AL160276.1-201ENST00000636672 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
AL160276.1-201ENST00000636672 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
AL160276.1-201ENST00000636672 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
AL160276.1-201ENST00000636672 OSCARQ8IYS5 282 aa42.21■■■■■ 4.35
AL160276.1-201ENST00000636672 CUX1P39880 1505 aa42.08■■■■■ 4.33
AL160276.1-201ENST00000636672 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.05■■■■■ 4.32
AL160276.1-201ENST00000636672 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.03■■■■■ 4.32
AL160276.1-201ENST00000636672 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.03■■■■■ 4.32
AL160276.1-201ENST00000636672 SOGA1O94964 1423 aa42.01■■■■■ 4.32
AL160276.1-201ENST00000636672 WDR97A6NE52 1622 aa41.89■■■■■ 4.3
AL160276.1-201ENST00000636672 CHD1O14646 1710 aa41.86■■■■■ 4.29
AL160276.1-201ENST00000636672 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
AL160276.1-201ENST00000636672 TRIM41Q8WV44 630 aa41.84■■■■■ 4.29
AL160276.1-201ENST00000636672 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.69■■■■■ 4.26
AL160276.1-201ENST00000636672 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.69■■■■■ 4.26
AL160276.1-201ENST00000636672 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.69■■■■■ 4.26
AL160276.1-201ENST00000636672 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.66■■■■■ 4.26
AL160276.1-201ENST00000636672 FBLN2P98095 1184 aa41.64■■■■■ 4.26
AL160276.1-201ENST00000636672 GRIN2BQ13224 1484 aa41.62■■■■■ 4.25
AL160276.1-201ENST00000636672 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.59■■■■■ 4.25
AL160276.1-201ENST00000636672 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
AL160276.1-201ENST00000636672 ARHGEF11O15085 1522 aa41.59■■■■■ 4.25
AL160276.1-201ENST00000636672 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.59■■■■■ 4.25
AL160276.1-201ENST00000636672 PBRM1Q86U86 1689 aa41.58■■■■■ 4.25
AL160276.1-201ENST00000636672 TOP2BQ02880 1626 aa41.56■■■■■ 4.24
AL160276.1-201ENST00000636672 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.53■■■■■ 4.24
AL160276.1-201ENST00000636672 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.53■■■■■ 4.24
AL160276.1-201ENST00000636672 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.52■■■■■ 4.24
AL160276.1-201ENST00000636672 SYNJ1O43426 1573 aa41.51■■■■■ 4.24
AL160276.1-201ENST00000636672 SYNJ2O15056 1496 aa41.44■■■■■ 4.22
AL160276.1-201ENST00000636672 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
AL160276.1-201ENST00000636672 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.35■■■■■ 4.21
AL160276.1-201ENST00000636672 ARAP1Q96P48 1450 aa41.2■■■■■ 4.19
AL160276.1-201ENST00000636672 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.18■■■■■ 4.18
AL160276.1-201ENST00000636672 ADAMTS12P58397 1594 aa41.16■■■■■ 4.18
AL160276.1-201ENST00000636672 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
AL160276.1-201ENST00000636672 GRIN2AQ12879 1464 aa41.09■■■■■ 4.17
AL160276.1-201ENST00000636672 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
AL160276.1-201ENST00000636672 CEP170Q5SW79 1584 aa40.94■■■■■ 4.14
AL160276.1-201ENST00000636672 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
AL160276.1-201ENST00000636672 SHROOM2Q13796 1616 aa40.76■■■■■ 4.11
AL160276.1-201ENST00000636672 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.72■■■■■ 4.11
AL160276.1-201ENST00000636672 KIF27Q86VH2 1401 aa40.71■■■■■ 4.11
AL160276.1-201ENST00000636672 CUL7Q14999 1698 aa40.63■■■■■ 4.09
AL160276.1-201ENST00000636672 IGF1RP08069 1367 aa40.62■■■■■ 4.09
AL160276.1-201ENST00000636672 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.59■■■■■ 4.09
AL160276.1-201ENST00000636672 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 198.6 ms