RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.76■■■■■ 7.32
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C9orf50-201ENST00000372478 NACADO15069 1562 aa50.57■■■■■ 5.69
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C9orf50-201ENST00000372478 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.22■■■■■ 5.63
C9orf50-201ENST00000372478 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.56■■■■■ 5.52
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C9orf50-201ENST00000372478 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.96■■■■■ 5.27
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C9orf50-201ENST00000372478 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.51■■■■■ 5.2
C9orf50-201ENST00000372478 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.36■■■■■ 5.17
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C9orf50-201ENST00000372478 SMARCA2P51531 1590 aa46.7■■■■■ 5.07
C9orf50-201ENST00000372478 NCAPD3P42695 1498 aa46.65■■■■■ 5.06
C9orf50-201ENST00000372478 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.59■■■■■ 5.05
C9orf50-201ENST00000372478 HMGXB3Q12766 1538 aa46.46■■■■■ 5.03
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C9orf50-201ENST00000372478 ERCC6Q03468 1493 aa45.22■■■■■ 4.83
C9orf50-201ENST00000372478 CFTRP13569 1480 aa45.12■■■■■ 4.81
C9orf50-201ENST00000372478 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.07■■■■■ 4.81
C9orf50-201ENST00000372478 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.04■■■■■ 4.8
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C9orf50-201ENST00000372478 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.84■■■■■ 4.77
C9orf50-201ENST00000372478 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
C9orf50-201ENST00000372478 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.76■■■■■ 4.76
C9orf50-201ENST00000372478 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.62■■■■■ 4.73
C9orf50-201ENST00000372478 CUX2O14529 1486 aa44.58■■■■■ 4.73
C9orf50-201ENST00000372478 WDR62O43379 1518 aa44.46■■■■■ 4.71
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C9orf50-201ENST00000372478 ABCC8Q09428 1581 aa44.1■■■■■ 4.65
C9orf50-201ENST00000372478 CUX1P39880 1505 aa43.96■■■■■ 4.63
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C9orf50-201ENST00000372478 IFT140Q96RY7 1462 aa43.78■■■■■ 4.6
C9orf50-201ENST00000372478 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.76■■■■■ 4.6
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C9orf50-201ENST00000372478 TOP2BQ02880 1626 aa43.63■■■■■ 4.57
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C9orf50-201ENST00000372478 SOGA1O94964 1423 aa43.62■■■■■ 4.57
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C9orf50-201ENST00000372478 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.41■■■■■ 4.54
C9orf50-201ENST00000372478 WDR97A6NE52 1622 aa43.4■■■■■ 4.54
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C9orf50-201ENST00000372478 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.01■■■■■ 4.48
C9orf50-201ENST00000372478 TRIM41Q8WV44 630 aa42.93■■■■■ 4.46
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C9orf50-201ENST00000372478 CHD1O14646 1710 aa42.9■■■■■ 4.46
C9orf50-201ENST00000372478 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.9■■■■■ 4.46
C9orf50-201ENST00000372478 FBLN2P98095 1184 aa42.85■■■■■ 4.45
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C9orf50-201ENST00000372478 KIF27Q86VH2 1401 aa42.8■■■■■ 4.44
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C9orf50-201ENST00000372478 SYNJ2O15056 1496 aa42.75■■■■■ 4.43
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C9orf50-201ENST00000372478 ADAMTS12P58397 1594 aa42.71■■■■■ 4.43
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C9orf50-201ENST00000372478 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.6■■■■■ 4.41
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C9orf50-201ENST00000372478 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.59■■■■■ 4.41
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C9orf50-201ENST00000372478 NUP160Q12769 1436 aa42.3■■■■■ 4.36
C9orf50-201ENST00000372478 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.16■■■■■ 4.34
C9orf50-201ENST00000372478 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.16■■■■■ 4.34
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C9orf50-201ENST00000372478 ARHGEF11O15085 1522 aa42.15■■■■■ 4.34
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C9orf50-201ENST00000372478 EEA1Q15075 1411 aa42.12■■■■■ 4.33
C9orf50-201ENST00000372478 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
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