Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACS1Q6VY07 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PACS1Q6VY07 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms