Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPATA1Q5VX52 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPATA1Q5VX52 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPATA1Q5VX52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPATA1Q5VX52 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA1Q5VX52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms