Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSHL1Q14406 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSHL1Q14406 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSHL1Q14406 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSHL1Q14406 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSHL1Q14406 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSHL1Q14406 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSHL1Q14406 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSHL1Q14406 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSHL1Q14406 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSHL1Q14406 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSHL1Q14406 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms