Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT88Q13099 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT88Q13099 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT88Q13099 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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