Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT88Q13099 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT88Q13099 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
IFT88Q13099 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT88Q13099 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFT88Q13099 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT88Q13099 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IFT88Q13099 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT88Q13099 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT88Q13099 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT88Q13099 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IFT88Q13099 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT88Q13099 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT88Q13099 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IFT88Q13099 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
IFT88Q13099 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
IFT88Q13099 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
IFT88Q13099 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
IFT88Q13099 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
IFT88Q13099 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
IFT88Q13099 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
IFT88Q13099 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
IFT88Q13099 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
IFT88Q13099 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
IFT88Q13099 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
IFT88Q13099 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IFT88Q13099 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
IFT88Q13099 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT88Q13099 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT88Q13099 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT88Q13099 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IFT88Q13099 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IFT88Q13099 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFT88Q13099 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFT88Q13099 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IFT88Q13099 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT88Q13099 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT88Q13099 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT88Q13099 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT88Q13099 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT88Q13099 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFT88Q13099 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFT88Q13099 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFT88Q13099 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IFT88Q13099 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
IFT88Q13099 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IFT88Q13099 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFT88Q13099 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IFT88Q13099 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IFT88Q13099 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IFT88Q13099 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT88Q13099 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT88Q13099 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT88Q13099 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFT88Q13099 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFT88Q13099 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFT88Q13099 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT88Q13099 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT88Q13099 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT88Q13099 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT88Q13099 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT88Q13099 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT88Q13099 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT88Q13099 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT88Q13099 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT88Q13099 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT88Q13099 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT88Q13099 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFT88Q13099 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT88Q13099 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT88Q13099 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT88Q13099 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT88Q13099 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT88Q13099 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT88Q13099 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT88Q13099 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFT88Q13099 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT88Q13099 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT88Q13099 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT88Q13099 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT88Q13099 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT88Q13099 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT88Q13099 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
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