Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL28Q13084 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL28Q13084 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MRPL28Q13084 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL28Q13084 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL28Q13084 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms