Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MRPL28Q13084 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MRPL28Q13084 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MRPL28Q13084 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MRPL28Q13084 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRPL28Q13084 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRPL28Q13084 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPL28Q13084 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL28Q13084 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRPL28Q13084 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRPL28Q13084 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MRPL28Q13084 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MRPL28Q13084 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRPL28Q13084 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL28Q13084 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL28Q13084 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL28Q13084 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL28Q13084 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL28Q13084 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL28Q13084 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL28Q13084 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL28Q13084 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL28Q13084 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL28Q13084 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL28Q13084 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL28Q13084 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL28Q13084 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRPL28Q13084 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL28Q13084 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPL28Q13084 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL28Q13084 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL28Q13084 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL28Q13084 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL28Q13084 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL28Q13084 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL28Q13084 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL28Q13084 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPL28Q13084 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPL28Q13084 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL28Q13084 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL28Q13084 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL28Q13084 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL28Q13084 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL28Q13084 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL28Q13084 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL28Q13084 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL28Q13084 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL28Q13084 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL28Q13084 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL28Q13084 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL28Q13084 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL28Q13084 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL28Q13084 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL28Q13084 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL28Q13084 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRPL28Q13084 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL28Q13084 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL28Q13084 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL28Q13084 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL28Q13084 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MRPL28Q13084 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL28Q13084 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL28Q13084 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL28Q13084 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL28Q13084 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL28Q13084 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL28Q13084 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL28Q13084 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL28Q13084 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL28Q13084 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL28Q13084 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL28Q13084 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL28Q13084 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL28Q13084 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL28Q13084 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL28Q13084 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL28Q13084 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL28Q13084 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL28Q13084 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL28Q13084 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL28Q13084 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL28Q13084 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL28Q13084 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL28Q13084 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL28Q13084 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL28Q13084 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRPL28Q13084 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL28Q13084 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL28Q13084 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPL28Q13084 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL28Q13084 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL28Q13084 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL28Q13084 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL28Q13084 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL28Q13084 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL28Q13084 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPL28Q13084 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPL28Q13084 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPL28Q13084 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL28Q13084 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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