Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 C20orf204-201ENST00000358393 1466 ntTSL 230.78■■■□□ 2.522e-8■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 C20orf204-204ENST00000463337 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)28.11■■■□□ 2.092e-8■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.966e-7■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.892e-6■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 MAFG-203ENST00000574686 570 ntTSL 528.99■■■□□ 2.237e-7■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.366e-7■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.096e-7■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 215.46■□□□□ 0.076e-7■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.086e-7■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 324.35■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 522.67■■□□□ 1.222e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 320.03■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-218ENST00000510410 1745 ntTSL 229.42■■■□□ 2.31e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.841e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.751e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-212ENST00000507769 595 ntTSL 322.94■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-224ENST00000513544 497 ntTSL 522.4■■□□□ 1.181e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-214ENST00000508245 665 ntTSL 516.11■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-216ENST00000509806 706 ntTSL 315.07■□□□□ 01e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-223ENST00000513101 564 ntTSL 411.04□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 ACSF2-217ENST00000510262 407 ntTSL 510.75□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.87□□□□□ -1.478e-10■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 SLC16A3-210ENST00000580189 872 ntTSL 524.11■■□□□ 1.451e-11■■■■□ 23.4
FKBP4Q02790 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 518.26■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 23.3
FKBP4Q02790 MTA1-219ENST00000551236 461 ntTSL 315.45■□□□□ 0.069e-7■■■■□ 23.2
FKBP4Q02790 TEX22-202ENST00000548638 508 ntTSL 515.35■□□□□ 0.059e-7■■■■□ 23.2
FKBP4Q02790 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.393e-6■■■■□ 23.2
FKBP4Q02790 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 413.19□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 23.2
FKBP4Q02790 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 315.57■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.783e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 MTHFD1L-202ENST00000367308 996 ntTSL 522.5■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 FAM60A-208ENST00000543615 669 ntTSL 523.47■■□□□ 1.354e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.914e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-204ENST00000480904 493 ntTSL 36.47□□□□□ -1.374e-6■■■■□ 23.1
FKBP4Q02790 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 329.02■■■□□ 2.244e-7■■■■□ 23
FKBP4Q02790 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 518.06■□□□□ 0.484e-7■■■■□ 23
FKBP4Q02790 BIVM-206ENST00000491929 674 ntTSL 329.37■■■□□ 2.292e-6■■■■□ 23
FKBP4Q02790 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 320.19■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 23
FKBP4Q02790 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 517.43■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 23
FKBP4Q02790 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 310.17□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 23
FKBP4Q02790 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 22.9
FKBP4Q02790 TUBB3-212ENST00000556565 566 ntTSL 422.47■■□□□ 1.192e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-211ENST00000556536 925 ntTSL 321.46■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-213ENST00000557262 888 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-214ENST00000557490 806 ntTSL 520.17■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-210ENST00000555810 767 ntTSL 319.52■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-209ENST00000555609 1855 ntTSL 318.84■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-207ENST00000554927 561 ntTSL 217.86■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-202ENST00000553656 550 ntTSL 417.29■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 TUBB3-204ENST00000554116 542 ntTSL 415.47■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 322.03■■□□□ 1.123e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.198e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 523.3■■□□□ 1.322e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.652e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ATXN1-204ENST00000473388 1569 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ATXN1-205ENST00000479680 568 ntTSL 48.57□□□□□ -1.042e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ATXN1-210ENST00000498374 1648 ntTSL 1 (best)8.46□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ATXN1-207ENST00000483954 744 ntTSL 36.84□□□□□ -1.312e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ATXN1-208ENST00000492857 647 ntTSL 45.74□□□□□ -1.492e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 ATXN1-203ENST00000467008 3362 ntTSL 1 (best)3.63□□□□□ -1.832e-7■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 CTDSP1-214ENST00000497677 998 ntTSL 220.42■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 CTDSP1-205ENST00000452977 818 ntTSL 520.18■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 CTDSP1-212ENST00000494067 362 ntTSL 317.46■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 22.8
FKBP4Q02790 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.325e-7■■■■□ 22.7
FKBP4Q02790 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.075e-7■■■■□ 22.7
FKBP4Q02790 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.95e-7■■■■□ 22.7
FKBP4Q02790 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.75e-7■■■■□ 22.7
FKBP4Q02790 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 22.7
FKBP4Q02790 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 217.59■□□□□ 0.413e-7■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 431.6■■■□□ 2.654e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 SPON2-207ENST00000504871 581 ntTSL 430.58■■■□□ 2.492e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 527.54■■■□□ 24e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.962e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 SPON2-212ENST00000509233 549 ntTSL 425.14■■□□□ 1.622e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.324e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 SPON2-215ENST00000511672 557 ntTSL 421.91■■□□□ 1.12e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 220.72■□□□□ 0.914e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 SPON2-216ENST00000511679 556 ntTSL 520.13■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 518.91■□□□□ 0.624e-8■■■■□ 22.6
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 258.7 ms