RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358393.1

C20orf204-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 204, humanhuman

TSL 2

Gene C20orf204, Length 1,466 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf204-201ENST00000358393 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.29■■■■■ 6.92
C20orf204-201ENST00000358393 ABCC9O60706 1549 aa52.77■■■■■ 6.04
C20orf204-201ENST00000358393 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.3■■■■■ 5.96
C20orf204-201ENST00000358393 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.99■■■■■ 5.59
C20orf204-201ENST00000358393 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.74■■■■■ 5.55
C20orf204-201ENST00000358393 NACADO15069 1562 aa49.56■■■■■ 5.52
C20orf204-201ENST00000358393 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.51■■■■■ 5.52
C20orf204-201ENST00000358393 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.15■■■■■ 5.462e-11■■■■□ 23.8
C20orf204-201ENST00000358393 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.8■■■■■ 5.4
C20orf204-201ENST00000358393 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.72■■■■■ 5.39
C20orf204-201ENST00000358393 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.56■■■■■ 5.36
C20orf204-201ENST00000358393 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.25■■■■■ 5.31
C20orf204-201ENST00000358393 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.03■■■■■ 5.28
C20orf204-201ENST00000358393 SCRIBQ14160 1630 aa47.82■■■■■ 5.24
C20orf204-201ENST00000358393 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.78■■■■■ 5.24
C20orf204-201ENST00000358393 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.57■■■■■ 5.21
C20orf204-201ENST00000358393 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.52■■■■■ 5.2
C20orf204-201ENST00000358393 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
C20orf204-201ENST00000358393 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.79■■■■■ 4.92
C20orf204-201ENST00000358393 NCAPD3P42695 1498 aa45.78■■■■■ 4.92
C20orf204-201ENST00000358393 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.65■■■■■ 4.9
C20orf204-201ENST00000358393 ERCC6Q03468 1493 aa45.57■■■■■ 4.89
C20orf204-201ENST00000358393 SMARCA4P51532 1647 aa45.51■■■■■ 4.88
C20orf204-201ENST00000358393 CUX2O14529 1486 aa45.47■■■■■ 4.87
C20orf204-201ENST00000358393 SMARCA2P51531 1590 aa45.46■■■■■ 4.87
C20orf204-201ENST00000358393 HMGXB3Q12766 1538 aa45.39■■■■■ 4.86
C20orf204-201ENST00000358393 NESP48681 1621 aa45.25■■■■■ 4.83
C20orf204-201ENST00000358393 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
C20orf204-201ENST00000358393 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
C20orf204-201ENST00000358393 PEG3Q9GZU2 1588 aa45■■■■■ 4.79
C20orf204-201ENST00000358393 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.96■■■■■ 4.79
C20orf204-201ENST00000358393 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.77■■■■■ 4.76
C20orf204-201ENST00000358393 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
C20orf204-201ENST00000358393 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.58■■■■■ 4.73
C20orf204-201ENST00000358393 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.57■■■■■ 4.72
C20orf204-201ENST00000358393 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.42■■■■■ 4.7
C20orf204-201ENST00000358393 WIZO95785 1651 aa44.39■■■■■ 4.7
C20orf204-201ENST00000358393 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.21■■■■■ 4.67
C20orf204-201ENST00000358393 WDR62O43379 1518 aa44.08■■■■■ 4.65
C20orf204-201ENST00000358393 CEP164Q9UPV0 1460 aa44■■■■■ 4.63
C20orf204-201ENST00000358393 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.94■■■■■ 4.63
C20orf204-201ENST00000358393 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
C20orf204-201ENST00000358393 CFTRP13569 1480 aa43.84■■■■■ 4.61
C20orf204-201ENST00000358393 TRIM41Q8WV44 630 aa43.83■■■■■ 4.61
C20orf204-201ENST00000358393 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
C20orf204-201ENST00000358393 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
C20orf204-201ENST00000358393 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
C20orf204-201ENST00000358393 OSCARQ8IYS5 282 aa43.42■■■■■ 4.54
C20orf204-201ENST00000358393 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.34■■■■■ 4.53
C20orf204-201ENST00000358393 PRDM2Q13029 1718 aa43.25■■■■■ 4.51
C20orf204-201ENST00000358393 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
C20orf204-201ENST00000358393 IFT140Q96RY7 1462 aa43.11■■■■■ 4.49
C20orf204-201ENST00000358393 TOPBP1Q92547 1522 aa43.07■■■■■ 4.48
C20orf204-201ENST00000358393 ABCC8Q09428 1581 aa42.87■■■■■ 4.45
C20orf204-201ENST00000358393 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.86■■■■■ 4.45
C20orf204-201ENST00000358393 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.86■■■■■ 4.45
C20orf204-201ENST00000358393 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.86■■■■■ 4.45
C20orf204-201ENST00000358393 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.85■■■■■ 4.45
C20orf204-201ENST00000358393 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
C20orf204-201ENST00000358393 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.72■■■■■ 4.43
C20orf204-201ENST00000358393 ARHGEF11O15085 1522 aa42.71■■■■■ 4.43
C20orf204-201ENST00000358393 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
C20orf204-201ENST00000358393 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
C20orf204-201ENST00000358393 FBLN2P98095 1184 aa42.57■■■■■ 4.41
C20orf204-201ENST00000358393 CHD1O14646 1710 aa42.53■■■■■ 4.4
C20orf204-201ENST00000358393 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.52■■■■■ 4.4
C20orf204-201ENST00000358393 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.5■■■■■ 4.39
C20orf204-201ENST00000358393 SOGA1O94964 1423 aa42.45■■■■■ 4.39
C20orf204-201ENST00000358393 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
C20orf204-201ENST00000358393 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.34■■■■■ 4.37
C20orf204-201ENST00000358393 ARAP1Q96P48 1450 aa42.29■■■■■ 4.36
C20orf204-201ENST00000358393 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.26■■■■■ 4.36
C20orf204-201ENST00000358393 CUX1P39880 1505 aa42.24■■■■■ 4.35
C20orf204-201ENST00000358393 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
C20orf204-201ENST00000358393 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
C20orf204-201ENST00000358393 WDR97A6NE52 1622 aa42.12■■■■■ 4.33
C20orf204-201ENST00000358393 GRIN2BQ13224 1484 aa42.07■■■■■ 4.32
C20orf204-201ENST00000358393 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
C20orf204-201ENST00000358393 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.04■■■■■ 4.32
C20orf204-201ENST00000358393 SYNJ1O43426 1573 aa42■■■■■ 4.31
C20orf204-201ENST00000358393 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.98■■■■■ 4.31
C20orf204-201ENST00000358393 SYNJ2O15056 1496 aa41.96■■■■■ 4.31
C20orf204-201ENST00000358393 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.9■■■■■ 4.3
C20orf204-201ENST00000358393 PBRM1Q86U86 1689 aa41.84■■■■■ 4.29
C20orf204-201ENST00000358393 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.79■■■■■ 4.28
C20orf204-201ENST00000358393 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.73■■■■■ 4.27
C20orf204-201ENST00000358393 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
C20orf204-201ENST00000358393 GRIN2AQ12879 1464 aa41.54■■■■■ 4.24
C20orf204-201ENST00000358393 ADAMTS12P58397 1594 aa41.46■■■■■ 4.23
C20orf204-201ENST00000358393 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.45■■■■■ 4.23
C20orf204-201ENST00000358393 TOP2BQ02880 1626 aa41.45■■■■■ 4.23
C20orf204-201ENST00000358393 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.43■■■■■ 4.22
C20orf204-201ENST00000358393 CEP170Q5SW79 1584 aa41.4■■■■■ 4.22
C20orf204-201ENST00000358393 NUP160Q12769 1436 aa41.38■■■■■ 4.21
C20orf204-201ENST00000358393 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.35■■■■■ 4.21
C20orf204-201ENST00000358393 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.24■■■■■ 4.19
C20orf204-201ENST00000358393 SHROOM2Q13796 1616 aa41.18■■■■■ 4.18
C20orf204-201ENST00000358393 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
C20orf204-201ENST00000358393 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
C20orf204-201ENST00000358393 JPH4Q96JJ6 628 aa41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms