Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL1Q00532 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL1Q00532 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL1Q00532 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL1Q00532 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms