Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AMY2BP19961 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMY2BP19961 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMY2BP19961 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms