Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM21P19474 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM21P19474 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM21P19474 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM21P19474 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms